格鲁马克斯 swMATH编号: 4128 软件作者: 马克·詹姆斯·亚伯拉罕;蒂穆·穆托拉(Teemu Murtola);罗兰·舒尔茨;Szilárd Páll;杰里米·史密斯;伯克·赫斯;林达尔 描述: GROMACS是一个多功能软件包,用于执行分子动力学,即模拟含有数亿到数百万粒子的系统的牛顿运动方程。它主要是为具有许多复杂键合相互作用的蛋白质、脂质和核酸等生化分子设计的,但由于GROMACS在计算非键合交互作用(通常在模拟中占主导地位)方面速度极快,许多团体也在使用它来研究非生物系统,例如聚合物 主页: http://www.gromacs.org/ 源代码: https://github.com/ElsevierSoftwareX/SOFTX-D-15-00003 编程语言: C/C++、Fortran 操作系统: UNIX、MacOS X 关键词: 分子动力学 相关软件: NAMD公司;查姆;LINCS系统;琥珀色;供应商管理部;车灯;CUDA公司;蟒蛇;德斯蒙德;开放式多媒体;插塞式;PyMOL公司;APBS公司;GROMOS公司;PROCHECK检查;FFTW公司;DL_POLY公司;I-TASSER公司;数字Py;结算 引用于: 122文件 其他出版物: http://www.gromacs.org/gromacs_papers网站 标准条款 1出版物描述软件 年份 GROMACS:通过从笔记本电脑到超级计算机的多级并行进行高性能分子模拟链接马克·詹姆斯·亚伯拉罕;蒂穆·穆托拉(Teemu Murtola);罗兰·舒尔茨;Szilárd Páll;杰里米·史密斯;伯克·赫斯;林达尔 2015 全部的 前5名416位作者引用 4 马库斯·韦伯 3 埃琳娜·阿赫玛茨卡娅 3 康斯坦丁·法克尔迪 3 徐振丽 2 哈桑·梅廷·阿克图加 2 埃米尔·阿列克索夫 2 Joshua A.安德森。 2 内森·贝克(Nathan A.Baker)。 2 纳瓦夫·M·布-拉贝。 2 W·迈克尔·布朗 2 亚历山大·布约泽克 2 高华坚 2 佩德罗·贡内特 2 卡斯滕·哈特曼 2 胡国辉 2 克里斯托夫·荣汉斯 2 孔勇 2 雷,欢 2 萨吉塔·卢鲁 2 史蒂文·普利普顿。 2 桑兹·塞尔纳(Jesús María Sanz-Serna) 2 克里斯托夫·施尤特 2 沈左伟 2 石兴华 2 弗拉基米尔·苏里莫夫。 2 亚历山大五世(Alexander V.Tikhonravov)。 2 杨建斌 2 周哲伟 1 穆罕默德·阿塔尔·阿巴斯 1 阿格拉哈里·阿什什·库马尔 1 萨姆兰·拉什·艾哈迈迪 1 安美文 1 Ananthasuresh,G.K。 1 马恩斯·安德森。 1 大流士·安德留凯提斯 1 瓦西里厄斯·安吉利达基斯 1 Angelikopoulos,泛神经炎 1 莎米拉·安尼谢蒂 1 Mikhail Yu Antonov。 1 拉尼·阿努帕马 1 阿克塞尔·阿诺德 1 穆罕默德·阿塔伊 1 阿齐兹-乌尔-雷曼 1 Subramanian巴布 1 白晓露 1 M.W.巴尔图森。 1 拉夫·巴尼什 1 乔治·巴拉科斯(George N.Barakos)。 1 保罗·T·鲍曼。 1 伊尔迪兹·巴亚齐托格鲁 1 约格·巴兹 1 Herman J.C.Berendsen。 1 理查德·伯杰 1 安德烈亚斯·比特拉彻 1 董事会,John A.jun。 1 Dan S.Bolintinanu。 1 法比奥·博纳科索 1 凯文·鲍尔斯。 1 Bozorgmehr,Mohammad Reza(穆罕默德·雷扎) 1 安东尼奥·塞尔吉奥·基莫斯(Antonio Sérgio Kimus Braz) 1 伊曼纽埃勒·布鲁扎 1 卜、兵 1 英国布伊斯特。 1 汉斯·约阿希姆·本加茨 1 马库斯·巴斯曼 1 费德里科·布蒂 1 Cacciagrano、Diletta Romana 1 蔡迪峰 1 蔡伟 1 卡梅隆、玛丽亚·库尔金娜 1 A.J.Palace卡瓦略 1 Casoni,E。 1 乔尼·卡斯塔尼亚 1 陈开贤 1 陈伟毅 1 陈晓林 1 契斯诺科夫,D.A。 1 莱蒂齐亚·奇奥多 1 Tim W.克拉克。 1 乔治·科伦坡 1 弗拉维奥·科拉迪尼 1 弗朗哥·S·科斯塔。 1 保罗·克罗齐尔。 1 爱德华多·克鲁。 1 安德烈亚·达纳尼 1 卡洛斯·安德烈斯·德尔瓦莱 1 法布里斯·德尔巴里 1 马修·德斯布伦 1 大卫·迪·朱斯托 1 刁嘉杰 1 Ken A.Dill。 1 伊芙琳·迪特默 1 查巴内·贾马尔 1 卢卡·多纳蒂 1 董靖 1 乔治·普里亚·多斯。 1 罗恩·德罗。 1 米希尔·杜尔夫 1 Beatriz Eguzkitza 1 迈克尔·恩格尔 …还有316位作者 全部的 前5名50篇连载文章中引用 18 计算物理杂志 13 理论生物学杂志 10 计算机物理通信 5 SIAM科学计算杂志 4 计算生物学和化学 3 应用力学与工程中的计算机方法 3 应用数学和力学。(英文版) 3 应用和计算谐波分析 3 数学化学杂志 3 洛巴切夫斯基数学杂志 3 力学学报 3 医学中的计算和数学方法 2 统计物理杂志 2 计算物理中的通信 1 机械学报 1 计算机和流体 1 计算机与数学及其应用 1 国际传热与传质杂志 1 国际流体数值方法杂志 1 国际理论物理杂志 1 流体力学杂志 1 固体力学与物理杂志 1 数学生物科学 1 物理A 1 应用数学与计算 1 国际工程数值方法杂志 1 计算力学 1 日本工业与应用数学杂志 1 SIAM审查 1 随机过程及其应用 1 非线性科学杂志 1 计算优化与应用 1 计算神经科学杂志 1 边界元工程分析 1 运筹学国际交易 1 混乱 1 伦敦皇家学会会刊。系列A.数学、物理和工程科学 1 RAIRO公司。运筹学 1 工程计算方法档案 1 熵 1 中欧数学杂志 1 国际现代物理几何方法杂志 1 数字学报 1 科学与工程中的反问题 1 跨学科应用数学 1 理论物理交流 1 计算与图形统计杂志 1 数学控制及相关领域 1 基于分子的数学生物学 1 计算物理杂志:X 全部的 前5名23个字段中引用 48 数值分析(65-XX) 48 生物学和其他自然科学(92-XX) 32 统计力学,物质结构(82-XX) 16 流体力学(76-XX) 14 可变形固体力学(74-XX) 13 计算机科学(68至XX) 10 量子理论(81-XX) 9 概率论与随机过程(60-XX) 7 统计学(62-XX) 5 偏微分方程(35-XX) 5 光学、电磁理论(78-XX) 5 信息与通信理论、电路(94-XX) 4 经典热力学,传热(80-XX) 4 运筹学、数学规划(90-XX) 3 欧氏空间的调和分析(42至XX) 3 粒子和系统力学(70-XX) 2 组合数学(05-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 数论(11-XX) 1 线性代数和多线性代数;矩阵理论(15-XX) 1 动力系统和遍历理论(37至XX) 1 变分法与最优控制;最优化(49至XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文