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基因组比对

swMATH ID: 38450
软件作者: Lawrence M、Huber W、Pagès H、Aboyoun P、Carlson M、Gentleman R、Morgan M、Carey V
描述: 生物导体/R包基因组比对:短基因组比对的表示和操作。提供用于存储和操作短基因组比对的有效容器(通常通过将短读取与参考基因组对齐来获得)。这包括读取计数、计算覆盖率、连接检测和处理比对的核苷酸含量。
主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GenomicAlignments.html
依赖项: R(右)
相关软件: 基因组范围生物导体R(右)甲基试剂盒Rbowtie公司TFBS工具ggplot2俾斯麦业务连续性rGADEM公司iClusterPlus甲基寻求者rGREAT公司Trim Galore公司ggbio公司石油价格STAR公司intePareto公司MAnorm公司GISTIC2.0标准
引用于: 2文件

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