基因组比对 swMATH ID: 38450 软件作者: Lawrence M、Huber W、Pagès H、Aboyoun P、Carlson M、Gentleman R、Morgan M、Carey V 描述: 生物导体/R包基因组比对:短基因组比对的表示和操作。提供用于存储和操作短基因组比对的有效容器(通常通过将短读取与参考基因组对齐来获得)。这包括读取计数、计算覆盖率、连接检测和处理比对的核苷酸含量。 主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GenomicAlignments.html 依赖项: R(右) 相关软件: 基因组范围;生物导体;R(右);甲基试剂盒;Rbowtie公司;TFBS工具;ggplot2;俾斯麦;业务连续性;rGADEM公司;iClusterPlus;甲基寻求者;rGREAT公司;Trim Galore公司;ggbio公司;石油价格;STAR公司;intePareto公司;MAnorm公司;GISTIC2.0标准 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 阿卡林,阿尔图纳 1 佛兰德·弗兰克 1 迈克尔·劳伦斯。 1 摩根,马丁 1 乔纳森·罗宁 1 博拉·乌亚尔 2篇连载文章中引用 1 统计科学 1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列 在2个字段中引用 2 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文