MAnorm公司 swMATH ID: 38449 软件作者： Zhen Shao、Yijing Zhang、Guo-Cheng Yuan、Stuart H Orkin、David J Waxman 描述： MAnorm：用于定量比较ChIP-Seq数据集的稳健模型。ChIP-Seq被广泛用于表征转录因子和其他染色质相关蛋白的全基因组结合模式。尽管ChIP-Seq数据集的比较对于理解细胞类型依赖性和细胞状态特异性结合以及细胞特异性基因调控的研究至关重要，但很少有定量方法被开发出来。在这里，我们提出了一种简单有效的方法MAnorm，用于定量比较描述转录因子结合位点和表观遗传修饰的ChIP-Seq数据集。MAnorm推断的定量结合差异与靶基因表达的变化和细胞类型特异性调节因子的结合都有很强的相关性。 主页： https://manorm.readthedocs.io/en/latest/ 源代码： https://github.com/shao-lab/MAnorm 依赖项： 蟒蛇 相关软件： 甲基试剂盒;勒波蒂;TFBS工具;ggplot2;俾斯麦;基因组比对;业务连续性;rGADEM公司;iClusterPlus;甲基寻求者;rGREAT公司;Trim Galore公司;ggbio公司;石油价格;STAR公司;intePareto公司;GISTIC2.0标准;平息;normr公司;gmapR（gmapR） 引用于： 1文件 4位作者引用 1 阿卡林，阿尔图纳 1 佛兰德·弗兰克 1 乔纳森·罗宁 1 博拉·乌亚尔 连载1篇 1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文