基因组学 swMATH编号： 38443 软件作者： Altuna Akalin、Vedran Franke、Katarzyna Wreczycka、Alexander Gosdschan、Liz Ing-Simons、Bozena Mika-Gospodorz 描述： 生物导体/R包基因组：基因组间隔的总结和注释包。用户可以可视化和量化预定义功能区上的基因组间隔，如启动子、外显子、内含子等。基因组间隔表示具有定义染色体位置的区域，这些区域可能与得分相关，如HT-seq实验的对齐读取、TF结合位点、甲基化得分等。该软件包可以使用任何表格式的基因组特征数据，只要它具有关于基因组间隔位置的最小信息。此外，它可以使用BAM或BigWig文件作为输入。 主页： https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/genomation.html 依赖项： R（右） 相关软件： 甲基试剂盒;勒波蒂;TFBS工具;ggplot2;俾斯麦;基因组比对;业务连续性;rGADEM公司;iClusterPlus;甲基寻求者;rGREAT公司;Trim Galore公司;ggbio公司;石油价格;星形;intePareto公司;MAnorm公司;GISTIC2.0标准;平息;normr公司;gmapR（gmapR） 引用于： 1文件 4位作者引用 1 阿卡林，阿尔图纳 1 佛兰德·弗兰克 1 乔纳森·罗宁 1 博拉·乌亚尔 连载1篇 1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文