ProLanGO项目 swMATH ID: 37442 软件作者: 曹,R。;弗雷塔斯,C。;Chan,L。;孙,M。;姜浩。;陈,Z。 说明: ProLanGO:基于递归神经网络的神经机器翻译蛋白质功能预测。随着下一代测序技术的发展,由于传统生物实验技术的局限性,从蛋白质序列中提取有用信息的速度较慢,成本也较高。蛋白质功能预测一直是一个长期的挑战,以填补大量蛋白质序列与已知功能之间的差距。本文提出了一种新的方法,将新提出的蛋白质序列语言“ProLan”转换为蛋白质功能语言“GOLan”,将蛋白质功能问题转化为语言翻译问题,并建立了基于递归神经网络的神经机器翻译模型,将“ProLan”语言翻译为“GOLan”语言。我们在2016年参加了最新的第三次功能注释关键评估(CAFA 3),对我们的方法进行了盲目的测试,并评估了我们的方法在选定的功能在CAFA竞争后释放的蛋白质上的性能。在训练和测试数据集上的良好性能表明,我们提出的新方法是蛋白质功能预测的一个很有前景的方向。总之,我们首次提出了一种将蛋白质功能预测问题转化为语言翻译问题的方法,并将神经机器翻译模型应用于蛋白质功能预测。 主页: https://arxiv.org/abs/1710.07016 相关软件: MetaGO公司;GOProFormer公司;多PredGO;DeepGO公司;协同因素;字符串;ProtVec公司;DeepGOPlus(深度GOPlus);UDSMProt公司;NetGO公司;亚当;UniProt公司;iDHS-EL公司;伦敦银行支持向量机;QAcon公司;PFRES公司;iNuc-STNC;iPhos-PseEn公司;iPPBS选择;iPro54-PseKNC 引用于: 2文件 全部的 前5名7位作者引用 1 贾苍志 1 阿克谢·迪帕克 1 戈帕拉克里希南,克里希纳萨米 1 青、杨 1 阿什什·兰扬 1 拉夫库什·夏尔马 1 李桃英 2篇连载文章中引用 1 数学生物科学 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文