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HBPred公司

swMATH ID: 37440
软件作者: Tang,H。;赵永伟。;邹,P。;张,C.M。;陈,R。;黄,P。;Lin,H。
描述: HBPred:一种识别生长激素结合蛋白的工具。激素结合蛋白(Hormone-binding protein,HBP)是一种可溶性载体蛋白,能与激素发生选择性、非共价相互作用。HBP在生命发育中起着重要作用,但其功能尚不清楚。正确识别HBP是进一步研究其功能和了解其生物过程的第一步。然而,由于实验成本高、实验周期长,通过传统的生化实验很难从越来越多的蛋白质中正确识别HBP。为了克服这些缺点,我们在研究中设计了一种计算方法来准确识别HBP。首先,我们从UniProt收集HBP数据,以建立高质量的基准数据集。基于数据集,从HBP残基序列中提取二肽成分。为了找出最佳特征,为HBP识别提供关键线索,对特征排序进行了各种方差分析。通过增量特征选择策略选择最优特征。随后,将特征输入到支持向量机(SVM)中进行预测模型构建。折刀交叉验证结果表明,88.6
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6036759/
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