SABER公司 swMATH ID: 33848 软件作者: 华堂、马克·科拉姆、王培、朱晓峰、尼尔·里奇 描述: SABER是一个适用于基因组规模数据的程序,该程序使用“Markov-hidden-Markov模型”来估计本地祖先(Tang H,Coram M,Wang P,Zhu X,Risch NJ。(2006)重建住院个体的遗传祖先块。美国人类遗传学杂志。79:1-12.). 这种当地血统被称为“祖先街区”。像HAPMIX一样,它模拟了祖先的LD;然而,它并没有模拟单倍型结构。输入文件是典型的,包括来自祖先和混合个体的基因型数据、混合个体的全球祖先估计值以及SNP的物理地图位置。除了提供本地化的祖先(带有图形输出)之外,SABER还可以用于估计混合后的时间。在被接纳个体中重建遗传祖先块 主页: http://med.stanford.edu/tanglab/software/saber.html 相关软件: 灯;HapMix公司;ADMIXMAP公司;结构;弗拉佩;外加剂;ipPCA公司;祖先地图;MALDsoft公司;艾根斯特拉;PLINK公司;GemTools(宝石工具);MSMS(座椅位置记忆系统) 引用于: 3文件 全部的 前5名7位作者引用 1 西米娜·博卡(Simina M.Boca)。 1 Buzbas、Erkan Ozge 1 陈华 1 嘿,乔迪 1 诺亚·A·罗森博格。 1 蒙哥马利·斯莱特金 1 保罗·威尔多 连载1篇 三 理论种群生物学 在3个字段中引用 三 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文