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PROSPERous公司

swMATH ID: 30466
软件作者: 宋江宁、李富毅、安德烈·雷尔、塔蒂亚娜·马奎兹·拉戈、阿克苏、戈兰雷扎·哈法里、郭振秋、杰弗里·韦伯、罗伯特·派克
描述: PROSPERous:高通量预测90种蛋白酶的底物裂解位点,精确度提高。蛋白酶是一种酶,可以特异性地裂解其目标蛋白的肽骨架。蛋白质裂解作为一种重要的不可逆翻译后修饰,是许多关键生理过程的基础。当失调时,蛋白酶的作用与许多疾病有关。许多蛋白酶具有高度的特异性,只裂解那些呈现特定氨基酸序列模式的目标底物。因此,成功识别蛋白酶潜在目标底物的工具也可以识别以前未知的生理相关切割位点,从而提供对生物过程的见解,并指导旨在验证蛋白酶-底物相互作用的假设驱动实验。在这项工作中,我们提出了PROSPERous,这是一种在计算机上快速预测底物序列中蛋白酶特异性切割位点的工具。我们的工具基于logistic回归模型,使用不同的评分函数及其成对组合来预测潜在的切割位点。PROSPERous是一种最先进的工具,能够快速、准确和高通量地预测90种蛋白酶的底物裂解位点。可用性和实施:http://prosperous.erc.monash.edu/
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5860617网址/
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