项目II swMATH ID: 29582 软件作者： Nam、J.W.、Kim、J.、Kim，S.K.、Zhang、B.T。 描述： ProMiR II：用于集群、非集群、保守和非保守microRNA概率预测的网络服务器。ProMiR是一种基于网络的服务，使用概率学习模型预测60-150 nt查询序列中的潜在microRNAs（miRNAs）。miRNA的鉴定需要一种计算方法来预测不同物种中聚集和非聚集、保守和非聚集的miRNA。在这里，我们提出了ProMiR的改进版本，用于识别已知或未知miRNAs附近的新簇。这个新版本ProMiR II整合了其他证据，如自由能数据、G/C比率、候选序列的保守性得分和熵，以便更可控地预测小鼠和人类基因组中的miRNAs。它还提供了更广泛的服务，例如在长的非相关序列（如病毒基因组）中预测miRNA基因。重要的是，我们已经通过几个案例研究验证了这种方法。ProMiR II中使用的所有数据都结构化在MySQL数据库中，以便进行有效分析。ProMiR II web服务器位于http://cbit.snu.ac.kr/项目R2/。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1538778/ 相关软件： 法国皇家医学会;DEGseq公司;星形底座;BSMAP公司;烘烤;天鹅绒;阿拉伯;拼接陷阱;DWE公司;CLIPZ公司;mir工具;miR表达;TargetSpy公司;miRNA键;PatMaN公司;塞克巴斯特;MiRonTop公司;MiPred公司;米拉分析仪;DIANA-mirExTra公司 引用于： 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 阿兰塞（Ana M.Aransay）。 1 埃尔南多·德尔·波蒂略。 1 阿兰·米切尔·达勒姆 1 迈克尔·哈肯伯格 1 阿丽亚娜·马查多·利马 1 罗德里格斯-埃兹佩列塔，奈亚拉 连载1篇 1 数学生物学杂志 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 按年份列出的引文