d2_群集 swMATH ID: 28788 软件作者： Burke，J.、Davison，D.、Hide，W。 描述： d2_cluster：一种有效的EST和全长cDNA序列聚类方法。目前正在通过聚类或组装的方式大规模浓缩单读表达序列标签（EST）和全长转录数据。这些项目的一个目标是构建基因索引，其中转录物被划分为索引类（或簇），使得它们被放入同一索引类，当且仅当它们代表同一基因时。准确的基因索引有助于通过组装EST来进行基因表达研究和廉价早期的部分基因序列发现，EST源自尚未通过基因组测序进行定位克隆或直接获得的基因。我们描述了d2_cluster，这是一种聚合算法，用于根据最小链接或“传递闭包”规则对序列进行聚类，从而快速准确地将转录数据库划分为索引类。然后，我们评估了d2_cluster相对于其他集群工具的相对效率。UniGene因其高质量和广泛接受而被选中进行比较。结果表明，尽管d2_cluster和UniGene产生的结果介于83之间 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC310833/ 相关软件： 莫菲;菲利普;彩虹;幻灯片排序;马什;紧身胸衣;石斑鱼;科根（Cogent）;LSC公司;最小值2;副帆;SimLoRD公司;易集群2;星号;MMseqs2型;DNACLUST公司;MeShClust公司;是ONclust;github;Cd命中 引用于： 5文件 全部的 前5名9位作者引用 三 米丽亚姆·鲁思·坎托罗维茨 2 康拉德·约翰·伯顿 2 苏珊·R·威尔逊。 1 达明达州阿拉哈库恩 1 苏珊·贝丁菲尔德（Susan E.Bedingfield）。 1 Hilary S.布斯。 1 乌普里·古纳辛格 1 保罗·梅德韦杰夫 1 克里斯托弗·萨林 4篇连载文章中引用 1 应用概率杂志 1 统计学和概率论字母 1 应用概率年鉴 1 理论生物学杂志 在4个字段中引用 4 生物学和其他自然科学（92-XX） 三 概率论与随机过程（60-XX） 1 统计学（62-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文