pLoc_bal-mGpos位置 swMATH ID: 27673 软件作者: Xiao,X。;Cheng,X。;陈,G。;毛泽东,Q。;周,K.-C。 描述: pLoc_bal-mGpos:通过准平衡训练数据集和PseAAC预测革兰氏阳性细菌蛋白质的亚细胞定位。蛋白质亚细胞定位的知识对基础研究和药物开发都至关重要。随着后基因组时代蛋白质序列的大量涌现,人们迫切需要开发计算工具,以便仅基于序列信息及时有效地识别其亚细胞定位。最近,开发了一种称为“pLoc-mGpos”的预测因子,用于识别革兰氏阳性细菌蛋白质的亚细胞定位。对于相同的目的,它的性能远远优于其他预测因子,尤其是在处理多标记系统时,其中一些称为“多重蛋白质”的蛋白质可能同时出现在两个或多个亚细胞位置。虽然它确实是一个非常强大的预测因子,但肯定需要更多的努力来进一步改进。这是因为pLoc-mGpos是由一个极为倾斜的数据集训练的,其中一些子集(亚细胞位置)的大小是其他子集的11倍以上。因此,它无法避免这样一个不均匀的训练数据集所导致的偏差后果。为了减轻这种偏差后果,我们通过准平衡训练数据集,开发了一种新的减少偏差的预测器pLoc_bal-mGpos。在完全相同的实验确认数据集上进行的严格的目标折刀试验表明,在识别革兰氏阳性细菌蛋白质的亚细胞定位方面,所提出的新预测因子明显优于现有的最先进预测因子pLoc-mGpos。为了最大限度地方便大多数实验科学家,已经在http://www.jci-bioinfo.cn/pLoc_bal-mGpos/用户无需经过详细的数学计算即可轻松获得所需的结果。 主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S088875431830260X 相关软件: pLoc-mGneg公司;pLoc-工厂;pLoc-mEuk公司;综合布线;pLoc-动物;pSuc-Lys公司;iRNA-PseColl基因;pLoc-m病毒;iRSpot-PseDNC公司;iRNAm5C-PseDNC;pLoc_bal-mHum位置;iKcr-PseEns公司;iRO-3wPseKNC;pLoc-mHum(位置-湿度);iRNA-3类型A;iPromoter-2L型;iRSpot-EL接口;iRNA人工智能;iPTM-mLys公司;iSuc-选择权 引用于: 11文件 全部的 前5名37位作者引用 三 周国成 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 努曼·拉苏尔 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 白晓露 1 艾哈迈德·哈桑 1 陈晓林 1 Chong,Kil To村 1 马里兰州Dewan Farid 1 马苏德·海亚特 1 他,林 1 瓦卡尔侯赛因 1 梅伦·贾米勒 1 贾建华 1 谢尔·阿夫扎尔·汗 1 李晓燕 1 梁云云 1 林,英 1 陆福华 1 陆千子 1 马志强 1 宁,乔 1 潘,易 1 邱、王仁 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 苏东青 1 希拉·塔亚拉 1 王世元 1 肖宣 1 杨磊 1 张琪 1 张胜利 1 赵晓伟 1 钟、洪斌 1 朱茂树 1 左永春 连载1篇 11 理论生物学杂志 在3个字段中引用 11 生物学和其他自然科学(92-XX) 8 计算机科学(68-XX) 5 统计学(62-XX) 按年份列出的引文