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iROS-gPseKNC

swMATH ID: 25363
软件作者: 宣晓、韩晓野、子刘、贾建华、郭振秋
描述: iROS-gPseKNC:通过将二核苷酸位置特异性倾向纳入一般伪核苷酸组成,预测DNA中的复制起始位点。DNA复制发生在所有生物体中,是生物遗传的基础,是由一个原始DNA分子产生两个相同复制品的过程。为了深入了解这一重要的生物过程并将其用于制定防治遗传病的新策略,DNA中复制起源位点的知识是必不可少的。随着DNA序列在后基因组时代的爆炸性增长,人们迫切希望开发出高通量的工具来纯粹基于序列信息来识别这些区域。本文通过将二核苷酸位置特异性倾向信息引入到一般伪核苷酸组成中,并使用随机森林分类器,提出了一种新的预测因子iROS-gPseKNC。严格的交叉验证表明,所提出的预测因子在敏感性、特异性、总体准确性和稳定性方面明显优于现有最佳方法。此外,已经为iROS-gPseKNC建立了一个用户友好的web服务器http://www.jci-bioinfo.cn/iROS-gPseKNC通过这种方法,用户可以很容易地获得他们想要的结果,而无需麻烦复杂的数学,而这些数学只是为了方法本身的完整性而提出的。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5085147/
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引用于: 8文件

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