负鼠 swMATH编号: 24532 软件作者: Wang,J。;杨,B。;Revote,J。;Leier,A。;马奎兹·拉戈,T.T。;网状物。;Lithgow,T。 描述: POSSUM:基于PSSM配置文件生成数字序列特征描述符的生物信息学工具包。位置特异性评分矩阵(PSSM)形式的进化信息是蛋白质序列的一种广泛使用且信息丰富的表示。因此,基于PSSM的特征描述符已成功应用于提高各种蛋白质属性预测因子的性能。尽管在以前的研究中已经提出了一些算法,但目前还没有通用的web服务器或工具包可用于生成这种种类繁多的描述符。在这里,我们介绍了POSSUM(用于机器学习的基于特定S取芯矩阵的特征生成器),这是一个带有在线web服务器的多功能工具包,可以生成21种基于PSSM的特征描述符,从而满足了生物信息学家和计算生物学家的关键需求。我们预计,该综合工具包将被广泛用作一个强大的工具,以促进基于机器学习模型的特征提取、选择和基准测试,从而为生物信息学研究提供更有效的分析和建模管道。可用性和实施:http://possum.erc.monash.edu/ . 主页: http://possum.erc.monash.edu/help.jsp 相关软件: 2L-piRNA;iRSpot-EL接口;iRNA-PseColl基因;pLoc-动物;PseKNC公司;综合布线;pLoc-m病毒;iPTM-mLys公司;pLoc-工厂;iPreny心理交流;iRNAm5C-PseDNC;iATC-mHyb公司;pLoc-mEuk公司;国际RNA-AI;pLoc-mHum(位置-湿度);iProt-Sub(iProt-Sub);pLoc-mGneg公司;一溴-2L;iRSpot-PseDNC公司;iSuc-选择权 引用于: 8文件 全部的 前5名27位作者引用 2 周国成 2 肖宣 2 张胜利 1 赛义德·艾哈迈德 1 程翔 1 阿卜杜拉·德赞吉 1 段欣 1 马苏德·海亚特 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 贾建华 1 可汗,穆斯林 1 谢尔·阿夫扎尔·汗 1 拉文德拉·库马尔 1 李晓燕 1 梁云云 1 卢千子 1 潘毅 1 邱、王仁 1 桑杰·萨哈 1 阿洛克·夏尔马 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 王世元 1 杨磊 1 张琪 1 左永春 连载1篇 8 理论生物学杂志 在3个字段中引用 8 生物学和其他自然科学(92-XX) 5 计算机科学(68至XX) 3 统计学(62-XX) 按年份列出的引文