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iRNA-2甲基

swMATH ID: 24530
软件作者: W.R.邱。;Jiang,S.Y。;Sun,B.Q。;Xia,X.夏。
说明: iRNA-2methyl:通过将序列耦合效应纳入通用PseKNC和集合分类器来识别RNA 2'-O-甲基化位点。目的:作为RNA的一种转录后修饰(PTCM),2’-全甲基化修饰也发生在生命发育和疾病形成过程中。因此,从基础研究和药物开发的角度来看,我们面临着一个具有挑战性的问题:给定一个由a(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤)和U(尿嘧啶)的许多核苷酸组成的无特征RNA序列,哪一个可以进行2-O’-甲基化修饰,而哪一个不能?不幸的是,到目前为止,还没有开发出任何计算方法来解决这个问题。方法:为了填补这个空白区域,我们提出了一个名为iRNA-2methyl的预测因子。它是通过将一系列序列耦合因子合并到通用PseKNC(伪核苷酸组成)中,然后将12个基本随机森林分类器融合到四个集合预测因子中而形成的,每个预测因子的目的是沿着相关RNA序列分别识别a、C、G和U的情况。结果:严格的折刀交叉验证表明成功率非常高(>93
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28641529
相关软件: iRNA-PseColl基因;综合布线;2L小核糖核酸;iSuc-选择权;iRSpot-EL接口;pLoc-mEuk公司;pLoc最小;iDNA6mA-PseKNC公司;iPTM-mLys公司;国际RNA-AI;pSuc-Lys公司;iRNA-PseU基因;iRNAm5C-PseDNC;pLoc-工厂;iPromoter-2L型;iPreny-PseAAC公司;iCar-PseCp公司;pLoc-m病毒;iMethyl-PseAAC(异甲基苯丙酮);iRSpot-PseDNC公司
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