iCar-PseCp公司 swMATH ID: 23951 软件作者： 贾，J。；刘，Z。；肖，X。 描述： iCar-PseCp：通过蒙特卡罗取样和将序列耦合效应纳入一般PseAAC，确定蛋白质中的羰基化位点。羰基化是一种翻译后修饰（PTM或PTLM），在蛋白质分子的赖氨酸（K）、脯氨酸（P）、精氨酸（R）和苏氨酸（T）残基中添加羰基。羰基化在协调各种生物过程中起着重要作用，但它也与许多疾病有关，如糖尿病、慢性肺病、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、慢性肾功能衰竭和脓毒症。因此，从基础研究和药物开发的角度来看，我们面临着一个具有挑战性的问题：对于一个含有许多K、P、R或T残基的无特征蛋白质序列，哪些可以羰基化，哪些不能？为了解决这个问题，我们开发了一个名为iCar-PseCp的预测器，将序列耦合信息合并到一般伪氨基酸组成中，并通过蒙特卡罗抽样平衡倾斜的训练数据集以扩展阳性子集。对同一组羰基化已知蛋白质进行严格的目标交叉验证表明，新的预测因子显著优于现有的预测因子。为了方便大多数实验科学家，已经在http://www.jci-bioinfo.cn/iCar-PseCp用户无需通过复杂的数学方程即可轻松获得所需的结果。我们注意到，这里提出的公式和方法也可以用于分析计算蛋白质组学中的许多其他问题。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5085176/ 相关软件： iPTM毫升；iRSpot-PseDNC公司；综合布线；iSuc-选择权；pSuc-Lys公司；iHyd-PseCp公司；iRNA-PseColl基因；国际RNA-AI；iRSpot-EL接口；iPhos-PseEn公司；pSumo光盘；pLoc-动物；普南-PC；2L小核糖核酸；pLoc-mGneg公司；iPPI-Esml接口；iKcr心理健康；iRNAm5C-PseDNC；pLoc-mEuk公司；国际有色人种协进会 引用于： 18文件 全部的 前5名59位作者引用 三 马苏德·海亚特 2 周国成 2 纳迪姆·伊克巴尔 2 可汗，穆斯林 2 宁，乔 2 肖宣 2 赵晓伟 1 谢赫·阿迪利娜 1 贾马尔·艾哈迈德 1 赛义德·艾哈迈德 1 安纪勇 1 穆罕默德·阿里夫 1 卞永涛 1 曹天杰 1 陈晓文 1 程翔 1 Chong，Kil To村 1 蒂塔拉吉·达什 1 de Galan，巴斯蒂安E。 1 杜普峰 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅毅 1 高，杨 1 西蒙·戈德。 1 Jan，扎胡尔 1 纪金超 1 贾建华 1 穆赫塔吉·汗 1 谢尔·阿夫扎尔·汗 1 Melvin Khee-Shing，利奥 1 李广平 1 李晓燕 1 梁云云 1 吕英丽 1 马志强 1 马库布尔，H.F。 1 梅，胡安 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆亚双 1 Pai，Priyadarshini P。 1 邱、王仁 1 萨布，M.法兹利 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 希拉尔·塔亚拉 1 王军 1 王丽东 1 王世元 1 杨磊 1 尹明浩 1 翟景轩 1 张宏瑞 1 张瑞军 1 张胜利 1 张，叶 1 赵，季 1 赵薇 1 周，孟 1 周元科 1 左永春 连载1篇 18 理论生物学杂志 在5个字段中引用 18 生物学和其他自然科学（92-XX） 6 计算机科学（68至XX） 5 统计学（62-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文