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pSumo光盘

swMATH ID: 23949
软件作者: 贾,J。;张,L。;刘,Z。
描述: pSumo-CD:通过将序列耦合效应纳入一般PseAAC,使用协方差判别算法预测蛋白质中的sumoylation位点。动机:氨酰化是一种翻译后修饰(PTM)过程,在该过程中,小的泛素相关修饰物(SUMO)通过共价键连接到底物蛋白质上。它对许多不同的生物过程至关重要,例如复制基因组、表达基因、定位和稳定蛋白质;不幸的是,它还与许多主要疾病有关,包括阿尔茨海默病和帕金森病。因此,无论是基础研究还是药物开发,鉴定蛋白质中的琥珀酰化位点都很重要。结果:为了解决这个问题,我们开发了一个名为pSumo-CD的预测器,将序列耦合信息合并到一般伪氨基酸组成(PseAAC)中,并引入协方差判别(CD)算法,其中偏差调整项,它具有自动调整由于训练数据不平衡而产生的偏差所引起的误差的功能。严格的交叉验证表明,在相同的目的下,新的预测值显著优于现有的最新预测方法。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,pSumo-CD的用户友好的网络服务器已经在http://www.jci-bioinfo.cn/pSumo-CD用户无需通过复杂的数学方程即可轻松获得所需的结果。
主页: http://www.jci-bioinfo.cn/pSumo-CD
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