Pfold(折叠) swMATH ID: 23813 软件作者: Knudsen,B。;J.J.海因。 描述: Knudsen,B。;Hein,J.J.:Pfold:使用随机无上下文文法预测RNA二级结构。RNA二级结构在许多生物过程中都很重要,有效的结构预测可以为实验研究提供重要的方向。许多可用的RNA二级结构预测程序一次只使用一个序列。这在某些应用中可能就足够了,但通常可以获得具有保守二级结构的相关RNA序列。这些应包括在结构分析中,以获得更好的结果。这项工作提出了一种预测RNA二级结构的实用方法,在获得相关序列时尤其有用。该方法改进了以前基于显式进化模型和结构概率模型的算法。可以在web服务器上进行预测网址:http://www.daimi.au.dk/compbio/pfold公司 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12824339 相关软件: 百万倍;UNA折叠;tRNA扫描-SE;RNA形状;NNDB公司;RNA动力学;HotKnots(热结);控制折叠;RSEACH公司;TP结构;RNA子点;RNA折叠;KineFold公司;蟒蛇;数学软件;ProbKnot(探针结);jViz公司。雷纳(Rna);IP结;科福尔加;ddbRNA 引用于: 10文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 Pfold:使用随机无上下文文法预测RNA二级结构。克努森(Bjarne Knudsen);佐敦海因 2003 全部的 前5名26位作者引用 三 彼得·克洛特(Peter G.Clote)。 2 埃文格洛斯·康斯坦蒂努·克拉纳基斯 2 丹尼·克里桑克 1 Andersen,Ebbe Sloth安徒生 1 布罗·布雷乔娃(Broňa Brejová) 1 丹尼尔·布朗(Daniel G.Brown)。 1 蔡丽明 1 JoséA·库斯塔。 1 克里斯蒂安·达姆加德 1 埃尔南多·德尔·波蒂略。 1 斯特凡·多布雷夫 1 伊万·多图 1 阿兰·米切尔·达勒姆 1 埃里克·福西 1 简·戈罗德金 1 克里斯汀·海奇(Christine E.Heitsch)。 1 黄,Fenix W.D。 1 杰姆斯、约根·K·。 1 阿丽亚娜·马查多·利马 1 罗素·L·马伯格。 1 苏珊娜·曼鲁比亚。 1 斯维特拉纳·波兹纳诺维奇 1 克里斯汀·迈克尔·雷迪斯 1 尤里娅·加利西亚,豪尔赫·L。 1 托马什(Tomáš) 1 赵吉珍 全部的 前5名引用于6个系列 5 数学生物学杂志 1 数学生物科学 1 数学生物学通报 1 计算机与系统科学杂志 1 计算生物学和化学 1 理论生物学杂志 全部的 前5名在7个字段中引用 10 生物学和其他自然科学(92-XX) 5 组合数学(05-XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 计算机科学(68至XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 数值分析(65-XX) 1 统计力学,物质结构(82-XX) 按年份列出的引文