图标移位 swMATH ID: 23139 软件作者: Savorani F、Tomasi G、Engelsen SB 描述: icoshift:快速校准一维核磁共振谱的通用工具。代谢组学越来越受到科学和工业界的关注,这得益于核磁共振(NMR)波谱的高定性和定量信息水平。然而,一些化学和物理因素会影响核磁共振信号的绝对位置和相对位置,先验地消除这些影响并不总是可能或可取的。为了在事后消除核磁共振信号失准,文献中提出了几种算法。本文介绍的icoshift程序是一个开源、高效的程序,用于解决代谢组核磁共振数据分析中的信号对齐问题。icoshift算法基于光谱间隔的相关偏移,并使用FFT引擎同时对齐所有光谱。该算法被证明比文献中发现的类似方法更快,使得大数据集的全分辨率对齐可行,从而避免了诸如装箱之类的下采样步骤。该算法使用缺失值作为填充选项,以避免段边界处的光谱伪影。该算法是开源的,Matlab代码(包括文档)可以从www。 主页: https://github.com/mfitzp/icoshift网站 源代码: https://github.com/mfitzp/icoshift网站 依赖项: Matlab公司 相关软件: 打开DMAP;NoFold公司;卡纳;迁移率;RNA集群;IgRepertoire构造函数;GraphClust(图形俱乐部);RNA表面;Rnall公司;梅维;RNA链;格拉维斯托;墨卡托;INDDGO公司;树向导;星形底座;LocARNA扫描;COMPASS(指南针);Pfam公司;Numbat公司;马戏团 引用于: 1文件 1位作者引用 1 乔纳森·基思(Jonathan M.Keith)。 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 总体主题;集合(00-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文