Numbat公司 swMATH ID: 23106 软件作者： Schmitz C、Stanton-Cook M、Su X-C、Otting G、Huber T 描述： Numbat：使用伪接触位移将Deltachi张量拟合到分子坐标的交互式软件工具。由与蛋白质结合的顺磁性镧系元素引起的伪接触位移（PCS）效应在核磁共振波谱中越来越普遍，因为它们产生了一组互补的取向和长程结构约束。PCS是chi-sensor各向异性的一种表现形式，Deltachi张量反过来可以从PCS中确定。一旦Deltachi-张量确定，PCS就成为研究蛋白质结构和蛋白质-甘氨酸复合物的强大远程约束。在这里，我们介绍了新开发的软件包Numbat（为自动Deltachi张量测定构建的新的用户友好方法）。Numbat具有允许高度交互的图形用户界面（GUI），专门用于从一组实验测量的PCS和蛋白质结构坐标计算整套Deltachi张量参数（包括与蛋白质有关的形状、位置和方向）。通过使用PCS构建大肠杆菌DNA聚合酶III亚单位epsilon186和θ之间的复合物模型，说明了该程序在Linux和Windows操作系统中的使用。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18574699 相关软件： 打开DMAP;NoFold公司;卡纳;记录仪;RNA集群;Ig汇辑构建器;GraphClust（图形俱乐部）;RNA表面;Rnall公司;梅维;RNA链;格拉维斯托;墨卡托;INDDGO公司;树向导;星形底座;LocARNA扫描;COMPASS（指南针）;Pfam公司;马戏团 引用于： 1文件 1位作者引用 1 乔纳森·基思。 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文