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iRNA-甲基

swMATH ID: 22439
软件作者: Chen,W。;冯·P。;丁·H。;Lin,H。;周,K.-C。
描述: iRNA-甲基:使用伪核苷酸成分识别N(6)-甲基腺苷位点。N(6)-甲基腺苷(m(6)A)是RNA中最丰富的修饰之一,发生在具有一致基序GAC的腺嘌呤(A)上,在许多生物过程中起着非常重要的作用。m(6)A位点在基因组中的不均匀分布意味着,为了更好地理解m(6。尽管在这方面已经开发了一系列实验技术,但它们既耗时又昂贵。随着后基因组时代产生的RNA序列雪崩,迫切需要开发计算方法来及时识别其m(6)A位点。鉴于此,提出了一种称为“iRNA-Methy”的预测因子,该预测因子通过“伪二核苷酸组成”构建RNA序列,其中包含三种RNA物理化学性质。严格的交叉验证测试表明,iRNA-Methyl具有成为基因组分析有用工具的巨大潜力。为了方便大多数实验科学家,已在http://lin.uestc.edu.cn/server/iRNA-Methyl用户无需仔细阅读数学细节即可轻松获得所需结果。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26314792
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