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PseKNC公司

swMATH ID: 22436
软件作者: Chen,W。;Lei,T.-Y。;金博士。;Lin,H。;周,K.-C。
描述: PseKNC:用于生成伪K元组核苷酸组成的灵活web服务器。伪寡核苷酸组成或伪K-tuple核苷酸组成(PseKNC)可用于用离散模型或向量表示DNA或RNA序列,但仍保留大量序列顺序信息,尤其是全局或远程序列顺序信息,通过其组成的寡核苷酸的物理化学性质。因此,PseKNC方法在增强处理计算基因组学和基因组序列分析中许多问题的能力方面具有很大潜力。然而,处理不同的DNA或RNA问题可能需要不同种类的PseKNC。在这里,我们为PseKNC提供了一个灵活且用户友好的web服务器(位于http://lin.uestc.edu.cn/pseknc/default.aspx)用户可以通过选择各种参数和物理化学性质,根据需要轻松生成多种不同模式的PseKNC。此外,为了方便绝大多数实验科学家,我们提供了一个循序渐进的指南,介绍如何使用当前的web服务器生成他们想要的PseKNC,而无需遵循复杂的数学方程,这篇文章中所介绍的正是为了完整的PseKNC配方及其发展。预计PseKNC网络服务器将成为计算基因组学和基因组序列分析中非常有用的工具。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24732113
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