PseDNA-Pro公司 swMATH ID: 22424 软件作者: 刘,B。;徐,J。;扇,S。;Xu,R。;周,J。;Wang,X。 描述: PseDNA-Pro:结合Chou的PseAAC和物理化学距离变换鉴定DNA结合蛋白。DNA结合蛋白的鉴定是生物医学研究中的一个重要问题,因为DNA结合蛋白对各种细胞过程至关重要。目前,机器学习方法以不同的特点实现了最先进的性能。提高这些方法性能的关键一步是找到合适的蛋白质代表。在本研究中,我们提出了一种由三种基于序列的特征组成的特征向量,包括总氨基酸组成、Chou提出的伪氨基酸组成(PseAAC)和物理化学距离变换。这些特征不仅考虑了蛋白质的序列组成,还包含了蛋白质中氨基酸的序列顺序信息。将特征向量输入支持向量机(SVM)进行DNA结合蛋白的识别。提出的方法称为PseDNA-Pro。使用Jackknife测试在严格的基准数据集和独立测试数据集上进行的实验表明,PseDNA Pro可以实现高于80的精度 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27490858 相关软件: iRSpot-PseDNC公司;综合布线;repDNA;PseKNC公司;iMiRNA-PseDPC;iAMP-2L型;iNuc-PseKNC;iPPI-Esml接口;PseAAC公司;iLoc-动物;iDNA-甲基;PseKNC-概述;位置传感器;iPro54-PseKNC;国际有色人种协进会;iRNA-甲基;iSS-PseDNC公司;iSuc-选择权;iEnhancer-2L型;pSuc-Lys基因 引用于: 6文件 全部的 前5名16位作者引用 2 杜普峰 2 焦亚森 1 谢赫·阿迪利娜 1 伊萨亚斯·阿尔瓦拉多。 1 斯蒂芬·巴里杰。 1 蔡璐 1 埃内斯托·孔特拉斯·托雷斯 1 内斯托尔·库比兰 1 马里兰州Dewan Farid 1 冯永革 1 塞萨尔·R·加西亚·加卡斯。 1 高山寇 1 刘国庆 1 约瓦尼·马雷罗·庞斯 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 邢永强 连载1篇 6 理论生物学杂志 在3个字段中引用 6 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文