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iLoc-工厂

swMATH ID: 22419
软件作者: 吴振中。;Xiao,X。;周,K.-C。
说明: iLoc-Plant:一种多标记分类器,用于预测具有单个和多个位点的植物蛋白质的亚细胞定位。预测蛋白质亚细胞定位是一个具有挑战性的问题,特别是当查询蛋白可能同时存在于两个或多个不同的亚细胞定位位点上或在其间移动时。现有的大多数方法只能用于处理单位置蛋白质。事实上,多位置蛋白不应被忽视,因为它们通常具有一些值得我们注意的特殊功能。通过引入“多标记学习”方法,开发了一种新的预测器,称为iLoc-Plant,可用于处理包含单长和多长植物蛋白的系统。作为演示,使用iLoc-Plant对植物蛋白质的基准数据集进行了折刀交叉验证,该植物蛋白质被分为以下12个位置:(1)细胞膜,(2)细胞壁,(3)叶绿体,(4)细胞质,(5)内质网,(6)胞外,(7)高尔基体,(8)线粒体,(9)细胞核,(10)过氧化物酶体、(11)质体和(12)液泡,其中一些蛋白质属于两个或三个位置,但没有一个蛋白质≥25
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