iPro54-PseKNC swMATH ID: 22411 软件作者: 林,H。;邓永中。;丁·H。;Chen,W。;周,K.-C。 描述: iPro54-PseKNC:一种基于序列的预测因子,用于识别具有伪k元组核苷酸组成的原核生物中的sigma-54启动子。σ(54)启动子在原核基因组中是唯一的,负责转录碳和氮相关基因。随着后基因组时代产生的基因组序列雪崩,人们迫切需要开发自动化方法来快速有效地识别σ(54)启动子。在此,开发了一个名为“iPro54-PseKNC”的预测因子。在预测器中,DNA序列样本由一种名为“伪k元组核苷酸组成”的新特征载体配制,并通过增量特征选择程序进一步优化。iPro54-PseKNC的性能在严格的基准数据集上通过严格的折刀交叉验证测试进行了检验。作为一个用户友好的网络服务器,iPro54-PseKNC可以通过以下网址免费访问:http://lin.uestc.edu.cn/server/iPro54-PseKNC。为了方便绝大多数实验科学家,我们提供了一个循序渐进的协议指南,介绍了如何使用web服务器获得所需的结果,而无需遵循本文中提出的复杂数学,仅仅是为了其完整性。同时,我们还通过深入的统计分析发现,转录起始位点和翻译起始位点之间的距离分布受γ分布的控制,这可能为研究σ(54)启动子提供了一个基本的物理原理。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25361964 相关软件: 综合布线;iRSpot-PseDNC公司;pSuc-Lys基因;iRNA-PseColl基因;iRSpot-EL接口;iPPI-Esml接口;iPTM-mLys公司;2L-piRNA;国际RNA-AI;iAMP-2L型;PseKNC公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iDNA-甲基;邻硝基-Tyr;iPromoter-2L型;pLoc mEuk基因;iDNA6mA-PseKNC公司;pLoc-工厂;iRNAm5C PseDNC公司;pLoc-动物 引用于: 32文件 全部的 前5名被83位作者引用 5 周国成 5 马苏德·海亚特 三 谢尔·阿夫扎尔·汗 三 肖宣 2 法曼·阿里 2 塔姆吉杜尔·霍克 2 侯赛因,瓦卡尔 2 苏梅亚伊克巴尔 2 贾建华 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 努曼·拉苏尔 1 赛义德·艾哈迈德 1 沙希德·阿克巴 1 安纪勇 1 穆罕默德·阿里夫 1 卞永涛 1 蔡璐 1 贾苍志 1 曹俊哲 1 曹,伙计 1 曹天杰 1 陈国栋 1 陈一平菲比 1 程翔 1 Chiu、Jimmy Ka Ho 1 蒂塔拉吉·达什 1 泰拉姆·辛格·狄龙 1 杜普峰 1 冯勇 1 傅毅 1 Golzari,法希米 1 顾红红 1 郭新云 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 赛义德·贾利利 1 梅伦·贾米勒 1 Jan,扎胡尔 1 焦、熊 1 焦亚森 1 朱哲 1 可汗,穆斯林 1 高山寇 1 拉文德拉·库马尔 1 李晓燕 1 梁云云 1 刘冰翔 1 刘国庆 1 刘,子 1 卢千子 1 马尼梅加莱,D。 1 梅,胡安 1 阿夫德斯·米什拉 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆亚双 1 穆图·克里希南,S。 1 Pai,Priyadarshini P。 1 潘毅 1 青、杨 1 邱、王仁 1 拉赫曼,穆罕默德·苏赫尔 1 松巴兰加纳坦 1 Ehsan Saghapour 1 E.Siva桑卡里 1 穆罕默德·塞哈蒂 1 史少平 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 李桃英 1 苏米特·塔拉福德 1 田坤 1 马里兰州托基尔·艾哈迈德。 1 王丽东 1 王世元 1 邢永强 1 杨磊 1 Youu,Stephen Shing-Toung先生 1 于佳林 1 翟景轩 1 张瑞军 1 张胜利 1 赵,季 1 赵欣 1 左永春 2篇连载文章中引用 31 理论生物学杂志 1 数学生物科学 在3个字段中引用 32 生物学和其他自然科学(92-XX) 11 统计学(62-XX) 10 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文