树突镜 swMATH ID: 21230 软件作者： 丹尼尔·胡森（Daniel H.Huson）。；丹尼尔·里希特（Daniel C.Richter）。；Rausch，基督徒；德祖利安，托比亚斯；弗朗茨，马库斯；鲁普，雷古拉 描述： Dendroscope：大型系统发育树的交互式查看器。背景：进化研究需要软件来可视化和编辑系统发育树，因为越来越大的数据集，例如在表达分析或宏基因组学中出现的数据集。最好有一个以高效和用户友好的方式提供这些服务的程序，并且可以在所有主要操作系统上轻松安装和运行。尽管有大量的树可视化工具是免费提供的，但有些作为更全面的分析包的一部分，在一个或多个领域中都存在缺陷。它们要么缺乏一些标准的树木可视化技术或基本的图形和编辑功能，要么仅限于包含数万个分类群的小树。此外，许多程序很难安装或不适用于所有通用操作系统。结果：我们开发了一个新程序Dendroscope，用于系统发育树的交互式可视化和导航。该程序提供了所有标准的树可视化，并经过优化，可以在包含数十万个分类群的树上交互运行。该程序提供树编辑和图形导出功能。为了支持对大树的检查，Dendroscope提供了一种放大工具。该软件是用Java 1.4编写的，并为Linux/Unix、MacOS X和Windows XP提供了安装程序。结论：Dendroscope是一个用户友好的程序，用于可视化和导航小型和大型数据集的系统发育树。 主页： http://dendroscope.org/ 相关软件： MEGA公司;猿;RAxML公司;野兽;菲利普;R（右）;SPR超级树;自动电视;MSC四重奏;TriLoNet网络;杂色树;apTreeshape（树形图）;植物醇;LBFGS-B型;EMpht公司;结冰树;T-REX公司;ggplot2;Triplet最大切割;气体 引用于： 14文件 全部的 前5名32位作者引用 5 利奥·范·埃尔塞尔 4 史蒂文·凯尔克 三 塞琳·斯科纳瓦卡 2 马雷克·菲舍尔 2 凯萨琳娜·胡贝尔（Katharina T.Huber）。 2 西蒙·林茨 2 文森特·莫尔顿。 1 艾登·伯库 1 奥利维·博伊斯 1 伊丽莎白·布利特 1 贾诺什·Döcker 1 巴巴拉·霍兰德。 1 丹尼尔·胡森（Daniel H.Huson）。 1 乔纳森·基思。 1 乔纳森·克拉维特 1 阿利姆·拉达 1 詹姆斯·斯蒂芬·马龙 1 塔马拉·麦克赫德利泽 1 O'Reilly，Małgorzata M。 1 戈博尔·巴塔基 1 迈克尔·桑德森。 1 查尔斯·森普尔 1 Albert Ch.Soewongsono。 1 安德烈亚斯·斯皮尔纳 1 乔治·斯塔穆利斯 1 迈克尔·安东尼·斯蒂尔 1 利恩·斯托吉 1 王浩南 1 Tandy J.沃诺。 1 马蒂亚斯·韦勒 1 克里斯蒂娜·威克 1 吴道阳 全部的 前5名10连载 三 图形算法与应用杂志 2 算法 2 理论生物学杂志 1 数学生物科学 1 数学生物学通报 1 应用数学进展 1 SIAM离散数学杂志 1 电子统计杂志 1 计算生物学 1 分子生物学方法 全部的 前5名在7个字段中引用 12 生物学和其他自然科学（92-XX） 7 组合数学（05-XX） 4 计算机科学（68至XX） 2 总体主题；集合（00-XX） 1 数学逻辑和基础（03-XX） 1 统计学（62-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文