R/位点 swMATH ID: 20451 软件作者： Karl W Broman、Hao Wu、Gary Churchill、aunak Sen 描述： R/qtl是一个可扩展的交互式环境，用于在实验杂交中定位数量性状位点（qtl）。它是作为免费可用和广泛使用的统计语言/软件R的附加包实现的（参见R项目主页）。该软件作为R的附加软件的开发，使我们能够利用R提供的基本数学和统计功能以及强大的图形功能。此外，用户将受益于QTL映射软件与通用统计分析程序的无缝集成。我们的目标是使复杂的QTL映射方法广泛可用，并允许用户专注于建模而非计算。QTL定位计算方法的一个关键组成部分是用于处理缺失基因型数据的隐马尔可夫模型（HMM）技术。我们已经实现了主要的HMM算法，允许存在基因分型错误，用于回交、交叉和相位已知的四向杂交。当前版本的R/qtl包括通过区间映射（使用EM算法）、Haley-Knott回归和多重插补来估算遗传图谱、识别基因分型错误、执行单qtl基因组扫描和双qtl、二维基因组扫描的设施。所有这些都可以在存在协变量的情况下进行（如性别、年龄或治疗）。还可以通过多重插补和Haley-Knott回归拟合高阶QTL模型。R/qtl作为unix的源代码或Windows或Mac的编译代码分发。R/qtl根据GNU通用公共许可证发布。要下载软件，您必须同意该下载中的条款。 主页： 网址：http://www.rqtl.org/ 相关软件： R（右）;一幅地图;藤架;矩阵;网络网关;记录仪;PLINK公司;wgaim公司;ASMap（美国地图）;dlmap（dlmap）;qtlnet（qtlnet）;HUGIN公司;等效电路;AMIDST公司;拉米德斯;g雨水;瑞金;pcalg公司;处理;bn学习 引用于： 11文件 全部的 前5名36位作者引用 2 艾伦·阿蒂。 2 孙伟 1 马·戈扎塔·博格丹 1 陈，孟 1 程富霞 1 窦小玲 1 伊纳州霍舍利 1 胡成成 1 黄汉文 1 卡加·伊克斯塔特 1 乔纳森·基思。 1 Mark P.凯勒。 1 Kendziorski，C.M。 1 佐藤千木 1 李乐信 1 Jane W.Liang。 1 刘梦玲 1 陆文斌 1 阿基特鲁·梅诺 1 马格达莱娜·玛丽娜 1 埃利亚斯·查布·内托 1 马丁·波什 1 霍尔格·施温德 1 阿纳克·森 1 邵永钊 1 Shiroishi，Toshihiko先生 1 Toyoyuki高田 1 弗雷德·赖特（Fred A.Wright）。 1 Brian S.Yandell。 1 杨健 1 叶秀子 1 于荣东 1 张茵 1 周海波 1 朱军 1 邹飞 全部的 前5名6篇连载文章中引用 4 生物计量学 三 应用统计学年鉴 1 生物医学杂志 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 1 浙江大学学报。科学A 1 分子生物学方法 全部的 前5名在7个字段中引用 8 统计学（62-XX） 7 生物学和其他自然科学（92-XX） 4 数值分析（65-XX） 1 一般性和全局性主题；集合（00-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 计算机科学（68至XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文