iEnhancer-2L型 swMATH ID: 18831 软件作者: 刘斌;龙云芳;任龙;荀兰;郭振秋 描述: iEnhancer-2L:一个两层预测因子,用于通过伪k元组核苷酸组成识别增强子及其强度。动机:增强子是短调控DNA元素。它们可以与蛋白质(激活剂)结合以激活基因的转录,因此在真核生物中对促进基因转录起着关键作用。随着后基因组时代产生的DNA序列雪崩,开发计算方法及时从极其复杂的DNA序列中识别增强子是一项具有挑战性的任务。尽管在这方面已经做出了一些努力,但仅限于确定查询DNA元素是否为增强子。然而,根据生物活性和对靶基因的调节作用的不同水平,增强子应进一步分为强子和弱子。结果:鉴于此,提出了一种称为“iEnhancer-2L”的两层预测因子,该预测因子通过“伪k组核苷酸组成”构建DNA元素,并将六个DNA局部参数纳入其中。据我们所知,这是有史以来第一个用于识别增强子及其强度的计算预测因子。严格的交叉验证测试表明,iEnhancer-2L具有很高的潜力,可以成为基因组分析的有用工具。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,在http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iEnhancer-2L/用户无需仔细阅读数学细节即可轻松获得所需结果。 主页: http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iEnhancer-2L/ 相关软件: pLoc-动物;pSuc-Lys公司;综合布线;iPromoter-2L型;iRSpot-EL接口;iRNA-PseColl基因;pLoc-mEuk公司;iRSpot-PseDNC公司;pLoc-工厂;pLoc-mGneg公司;pLoc-m病毒;iPTM-mLys公司;2L-piRNA;iDNA6mA-PseKNC公司;iRNA-PseU基因;iPPI-Esml接口;iATC-mHyb公司;pLoc-mHum(位置-湿度);iRNA-3类型A;国际RNA-AI 引用于: 21文件 全部的 前5名67位作者引用 6 周国成 3 肖宣 2 瓦卡尔侯赛因 2 贾建华 2 谢尔·阿夫扎尔·汗 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 邱文英 2 努曼·拉苏尔 2 王世元 2 杨磊 2 于斌 2 左永春 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 陈,程 1 陈晓文 1 Chen,Yi Ping Phoebe 1 程翔 1 Chiu、Jimmy Ka Ho 1 崔晓文 1 泰拉姆·辛格·狄龙 1 杜俊伟 1 杜普峰 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅浩跃 1 傅毅 1 马苏德·海亚特 1 他,林 1 梅伦·贾米勒 1 焦亚森 1 朱哲 1 拉文德拉·库马尔 1 李珊 1 李晓燕 1 梁云云 1 林,英 1 刘冰翔 1 刘,子 1 陆福华 1 陆千子 1 吕英丽 1 马,秦 1 马尼梅加莱,D。 1 梅,胡安 1 潘毅 1 彭彦军 1 邱、王仁 1 埃桑萨哈普尔 1 E.Siva桑卡里 1 穆罕默德·塞哈蒂 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 田宝光 1 王明辉 1 王世云 1 吴雪 1 杨晨辉 1 杨连平 1 于兆敏 1 张琪 1 张胜利 1 张向德 1 赵,季 1 钟洪斌 1 周,孟 1 朱茂树 连载1篇 21 理论生物学杂志 在4个字段中引用 21 生物学和其他自然科学(92-XX) 11 计算机科学(68至XX) 7 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 按年份列出的引文