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PSI-爆炸

swMATH ID: 17324
软件作者： Altschul，S.F.、Madden，T.L.、Schäffer，A.A.、Zhang，J.、Zhang，Z.、Miller，W.、Lipman，D.J。
描述： 缺口BLAST和PSI-BLAST：新一代蛋白质数据库搜索程序。BLAST程序是广泛使用的工具，用于搜索蛋白质和DNA数据库中的序列相似性。对于蛋白质比较，这里描述的各种定义、算法和统计改进允许BLAST程序的执行时间大大缩短，同时提高它们对弱相似性的敏感性。触发单词点击扩展的新标准，结合生成间隙对齐的新启发式，产生了一个间隙BLAST程序，其运行速度大约是原始程序的三倍。此外，还引入了一种方法，用于自动将BLAST生成的具有统计意义的比对组合到位置特定的得分矩阵中，并使用该矩阵搜索数据库。生成的位置特定的迭代BLAST（PSIBLAST）程序以与间隙BLAST大致相同的每次迭代速度运行，但在许多情况下，对微弱但生物相关的序列相似性更为敏感。PSI-BLAST用于揭示BRCT超家族的几个新的有趣成员。
主页： http://nar.oxfordjournals.org/content/25/17/3389.short
相关软件： 爆炸;Pfam公司;UniProt公司;ClustalW公司;肌肉;伦敦银行支持向量机;位置传感器;Cd命中;KEGG公司;iRSpot-PseDNC公司;PROSITE公司;建模师;iLoc-Euk公司;iLoc-Virus病毒;AA索引;BLAT（爆炸）;pSuc-Lys公司;EMBOS公司;COMPASS（指南针）;拨号
引用于： 141文件
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4 阿卜杜拉·德赞吉
4 马西莫·迪·朱利奥
4 阿洛克·夏尔马
3 阿米尔·阿博德
3 梁云云
3 梅，苏玉
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3 张胜利
2 雅法·阿曼尼
2 巴巴克·纳贾尔·阿拉比
2 迭戈·博纳托
2 蔡玉东
2 亚历山德拉·卡博尼
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2 杜普峰
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2 塞耶德·拉蒂夫·穆萨维（Seyed Latif Mousavi）加加丽
2 达尼洛·古洛托
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2 贝扎德·莫西里
2 克里斯托弗·欧曼。
2 Pai，Priyadarshini P。
2 Paliwal，Kuldip K。
2 齐、赵辉
2 穆罕默德·雷扎·拉巴尔
2 伊拉克拉苏利
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2 约翰·L·斯波格。
2 Webb-Robertson，Bobbie-Jo M。
1 阿查里亚，廷库
1 希瓦尼·阿加瓦尔
1 阿圭罗·查宾（Guillermin Agüero-Chapin）
1 阿吉拉尔·鲁伊斯，耶稣·萨尔瓦多
1 贾马尔·艾哈迈德
1 爱塔，Takuyo
1 Akindahunsi，Akintunde A。
1 埃米尔·阿列克索夫
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1 Peter W.Arzberger。
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1 朱利奥·科拉多·维德斯
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1 崔新平
1 高塔姆·达斯
1 蒂塔拉吉·达什
1 亚历山大·G·德布雷文。
1 阿尔贝托·古斯塔沃·德拉里瓦
1 玛丽亚·迪亚·尤埃拉。
1 阿兰·丹尼斯
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55 理论生物学杂志
24 计算生物学和化学
3 数学生物科学
3 物理A
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3 理论计算机科学
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3 计算统计与数据分析
2 计算物理杂志
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1 数学分析与应用杂志
1 数学生物学杂志
1 数学生物学通报
1 统计学年鉴
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1 非线性分析。理论、方法和应用。系列A：理论与方法
1 理论种群生物学
1 并行计算
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1 查普曼和霍尔/CRC计算机和信息科学系列
1 分子生物学方法
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119 生物学和其他自然科学（92-XX）
45 计算机科学（68至XX）
24 统计学（62-XX）
11 运筹学、数学编程（90-XX）
5 组合数学（05-XX）
3 概率论与随机过程（60-XX）
2 数论（11-XX）
2 数值分析（65-XX）
1 总体主题；集合（00-XX）
1 数学逻辑和基础（03-XX）
1 测量和集成（28-XX）
1 功能分析（46倍X倍）
1 统计力学，物质结构（82-XX）
1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学（91-XX）
1 系统论；控制（93至XX）
1 信息与通信理论、电路（94-XX）

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