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阿斯塔拉维斯塔

swMATH ID: 17177
软件作者: Foissac S、Sammeth M
描述: ASTALAVISTA:定制基因数据集中选择性剪接事件的动态灵活分析。在建立越来越完整的真核生物基因组注释的过程中,在过去十年中,选择性剪接(AS)事件的数量不断增加。因此,不断增加的转录物覆盖率也揭示了转录物变体之间外显子-内含子结构的一些变化的真实复杂性,以及需要计算工具来处理“复杂”AS事件。ASTALAVISTA(选择性剪接转录景观可视化工具)采用直观完整的符号系统来识别此类事件。该方法从定制的基因注释中动态提取AS事件,将其分类为常见类型的组,并可视化生成的AS景观的综合图片。因此,ASTALAVISTA可以根据参考注释(GENCODE、REFSEQ、ENSEMBL)中的整个转录组数据以及用户根据感兴趣的常见功能/结构属性选择的基因来表征AS:http://genome.imm.es/astalavista网站
主页: http://genome.crg.es/astalavista网站/
相关软件: 爱琴海;ASPIC公司;ARB公司;EMBOS公司;最小值;埃米尔吉;维也纳RNA;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi;预GPI;SPEPlip公司;BaCelLo公司;PolyA_DB公司;ASPicDB公司;生物城;Astex查看器;;战争;PatSearch公司
引用于: 1文件

1位作者引用

1 埃内斯托·皮卡迪

按年份列出的引文