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生物集市

swMATH ID: 17171
软件作者: Zhang J、Haider S、Baran J、Cros A、Guberman JM、Hsu J、Liang Y、Yao L、Kasprzyk A
描述: BioMart:大型协作项目的数据联合框架。BioMart是一个免费可用的开放源码联邦数据库系统,提供对不同地理位置分布的数据源的统一访问。它的设计与数据无关,与平台无关,这样现有的数据库可以很容易地并入BioMart框架。BioMart允许在不同服务器上托管的数据库无缝呈现给用户,促进不同研究小组之间的合作项目。BioMart包含多个级别的查询优化,以有效管理大型数据集,并提供多种图形用户界面和应用程序编程界面选择,以确保可以以用户最方便的方式执行查询。该软件现已被大量不同的生物数据库所采用,这些数据库涵盖了广泛的数据类型,为生物信息学家和生物学家提供了丰富的注释来源。数据库URL:http://www.biorart.org网站
主页: http://database.oxfordjournals.org/content/2011/bar038.full
相关软件: R(右);ClustalW公司;BED工具;FIMO公司;IGV公司;片段基因扫描;BLAT(爆炸);VCF工具;香皂;法国皇家医学会;银河;NGS QC工具包;顶帽;快速质量控制;KEGG公司;边缘R;生物导体;STAR公司;RDP2号机组;PhyloBayes 3
引用于: 3文件

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