排序MeRNA swMATH ID: 17152 软件作者： Kopylova E、Noe L、Touzet H 描述： 快速过滤、映射和OTU拾取。SortMeRNA是一种程序工具，用于筛选、映射和OTU选择亚转录组和亚基因组数据中的NGS读取。核心算法基于近似种子，允许快速敏感地分析核苷酸序列。SortMeRNA的主要应用是从超转录组数据中筛选核糖体RNA。其他应用程序包括通过QIIME v1.9+提供的OTU拾取和分类分配(网址：http://qiime.org-v1.9.0-rc1）。SortMeRNA将读取文件（fasta或fastq格式）和一个或多个rRNA数据库文件作为输入，并将rRNA和被拒绝的读取分类为用户指定的两个文件。或者，它可以根据rRNA数据库提供rRNA读取的高质量局部比对。SortMeRNA与Illumina、454、Ion Torrent和PacBio数据一起工作，可以生成SAM和BLAST样的比对。 主页： http://bioinfo.lifl.fr/RNA/sortmerna/ 相关软件： ARB公司;EMBOS公司;最小值;埃米尔吉;维也纳RNA;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi;阿斯塔拉维斯塔;预GPI;SPEPlip公司;BaCelLo公司;多边形数据库;ASPicDB公司;生物城;Astex查看器;勺;战争;PatSearch（补丁搜索）;NGS QC工具包;ExpEdit（ExpEdit） 引用于： 1文件 由1位作者引用 1 埃内斯托·皮卡迪 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 一般性和全局性主题；集合（00-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文