伪查看器3 swMATH ID: 17134 软件作者： Byun Y、Han K 描述： 伪查看器3：生成带有伪结的大规模RNA结构的平面图。动机：RNA结构中的假结使RNA结构的可视化变得困难。即使伪结本身没有交叉，用伪结可视化整个RNA结构通常会导致绘制伪结和其他结构元素之间的交叉，并且需要用户进行额外干预，以确保结构图无重叠。许多程序（如web服务）倾向于一次性获得无重叠的图形，而不是获得要编辑的有重叠的图形。很少有程序可以可视化RNA假结，而PseudoViewer几乎是唯一一个自动绘制带有假结的RNA二级结构的程序。以前版本的PseudoViewer将所有已知类型的RNA伪结可视化为平面图，但将一些假设的伪结可视化成非平面图。结果：我们开发了一种新版本的PseudoViewer，用于有效地可视化带有任何类型的伪结的大RNA结构，无论是已知的还是假设的，都可以一次性绘制平面图。它比以前的算法快10倍左右，生成了更紧凑、更美观的结构图。PseudoViewer3支持web服务和web应用程序。可用性：PseudoViewer的新版本Pseudo Viewer3可在http://pseudo-viewer.inha.ac.kr。 主页： http://pseudoviewer.inha.ac.kr/ 相关软件： 维也纳RNA;R2R（卢比）;jViz公司。雷纳（Rna）;无间道;瓦尔纳;法国皇家医学会;RNA子点;RNA折叠;ARB公司;EMBOS公司;Minimus公司;酋长国;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi;阿斯塔拉维斯塔;预GPI;SPEPlip公司;BaCelLo公司;PolyA_DB公司 引用于： 3文件 全部的 前5名6位作者引用 1 仰光Byun 1 韩京洙 1 Thomas J.X.李。 1 月亮，桑勋 1 埃内斯托·皮卡迪 1 克里斯汀·迈克尔·雷迪斯 3篇连载文章中引用 1 数学生物学通报 1 计算生物学和化学 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 3 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 一般性和全局性主题；集合（00-XX） 1 组合数学（05-XX） 按年份列出的引文