RNA结构 swMATH ID: 17133 软件作者： 路透社JS，马修斯DH 描述： RNA结构：RNA二级结构预测和分析软件。背景：为了理解RNA序列的作用机制，必须了解其结构。此外，在设计小干扰RNA和反义DNA寡核苷酸时，目标RNA结构是一个重要的考虑因素。利用热力学对RNA二级结构进行预测，可以用来对RNA序列的结构进行假设。结果：RNAstructure是一个用于RNA二级结构预测和分析的软件包。它使用热力学，并使用特纳组中最新的一组最近邻参数。它包括二级结构预测（使用多种算法）、碱基对概率预测、双分子结构预测和两个序列共同结构预测的方法。本文描述了该包的新扩展，包括用于并入其他程序的C++类库、用JAVA编写的用户友好的图形用户界面，以及新的Unix样式的文本界面。Microsoft Windows的原始图形用户界面仍保持不变。结论：对RNA结构的扩展使RNA二级结构预测更加方便。该软件包可从马修斯实验室主页下载，网址为http://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructure.html。 主页： http://rna.urmc.rochester.edu/RNStructure.html 相关软件： 维也纳RNA;法国皇家医学会;CONTRAfold公司;OligoWalk公司;Cd命中;外部斜坡;TTA猞猁;大坝7;CodonW公司;CodonPhyML（密码物理ML）;ntCard（nt卡）;敏锐;PAML公司;密码测试;铝合金;xREI公司;RevTrans公司;MACSE公司;简易代码ML;壁画 引用于： 4文件 全部的 前5名11位作者引用 1 玛丽亚·安尼西莫娃 1 迪米特里·潘特利·贝尔塞卡斯 1 刘梦汉 1 大卫·默鲁加拉 1 博丹奥斯塔什 1 朱利亚·佩德里利 1 埃内斯托·皮卡迪 1 埃里克·波普莱顿 1 彼得·什乌尔克 1 德文·威尔莫特。 1 叶强 3篇连载文章中引用 1 信息计算杂志 1 计算和数学生物物理 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 一般性和全局性主题；集合（00-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文