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RNA静音

swMATH ID: 17059
软件作者: Churkin A、Gabdank I、Barash D
描述: 用于RNA二级结构突变分析的RNA静音网络服务器。二级结构水平的RNA突变分析可用于广泛的生物学应用。它可以用于预测在单个分子水平上进行核苷酸突变的最佳位置,以及在系统水平上分析基本现象。对于前者,随着更多的序列修饰实验的进行,包括定点诱变,以发现和探索RNA中的功能基序,有助于指导实验计划的预处理步骤变得至关重要。对于后者,突变通常被认为是进化发生的中心机制,与结构相关的突变分析应该更好地理解系统功能和进化。在过去几年中,开发了基于结构并依赖于RNA二级结构预测的RNAbute程序,用于协助RNA突变分析。它已从单点突变扩展到有效处理多点突变,方法是首先计算所有次优解,然后只考虑稳定次优解和破坏最优解的突变作为有害候选。突变分析的RNAmute网络服务器可在网址:http://www.cs.bgu.ac.il/xrnamute/xrnamute。
主页: http://nar.oxfordjournals.org/content/39/suppl_2/W92.short
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