DiffSplice（扩散拼接） swMATH ID: 17051 软件作者： 胡，Y，黄，Y，杜，Y，奥雷拉纳，C.F.，辛格，D.，约翰逊，A.R.，蒙罗伊，A.，宽，P.F.，哈蒙德，S.M.，马考斯基，L.，兰德尔，S.H.，蒋，D.Y.，海斯，D.N.，琼斯，C.，刘，Y.，普林斯，J.F.，刘，J。 描述： DiffSplice：用RNA-seq在全基因组范围内检测差异剪接事件。RNA测序在转录水平上为全基因组表达提供了前所未有的可视性。DiffSplice是一种新的工具，用于发现和量化RNA-seq数据集中存在的选择性剪接变体，而无需依赖带注释的转录组或预先确定的剪接模式。对于两组样本，DiffSplice进一步利用非参数置换测试来确定基因水平和转录水平表达的显著差异。DiffSplice将提供参考基因组上RNA-seq读取比对的SAM文件作为输入，该比对来自类似MapSplice的RNA-seqaligner。DiffSplice的结果总结为基因组的分解，可以使用UCSC基因组浏览器进行可视化。 主页： http://www.netlab.uky.edu/p/bioinfo/DiffSplice网站 相关软件： MOABS公司;全球气候变化评估;BaySeq公司;拼接陷阱;rSeqDiff（序列差异）;EB序列;顶帽;双ExpSeq;Voom公司;利马;DEseq公司;边缘R;生物导体;对;CRAN（起重机） 引用于： 1文件 3位作者引用 1 玛拉·约翰逊 1 伊丽莎白·普多姆 1 肖恩·鲁迪 连载1篇 1 应用统计学年鉴 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文