普罗卡 swMATH ID: 16996 软件作者： 托尔斯滕·西曼 描述： Prokka：快速原核基因组注释。摘要：当今DNA测序仪器的多重功能和高产率使细菌全基因组测序成为一项常规工作。随后的重新组装读入contigs的问题得到了很好的解决。使用现有的基于网络和电子邮件的系统，可以缓慢完成在这些contig上注释所有相关基因组特征的最后一步，但这些系统不适用于敏感数据或集成到计算管道中。在这里，我们介绍了Prokka，一个命令行软件工具，可以在典型的台式计算机上在大约十分钟内对细菌基因组草图进行完整注释。它生成符合标准的输出文件，用于进一步分析或在基因组浏览器中查看。可用性和实现：Prokka是在Perl中实现的，并且可以通过以下开源GPLv2许可证免费获得：http://vicbioinformationary.com/。 主页： http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2014/03/18/bioinformatics.btu153.short 相关软件： HMMER公司；MAFFT公司；鸡蛋NOG；R（右）；古宾斯；IQ树；SeqKit（服务工具包）；SNVPhyl公司；阿尔帕卡；猿；潘戈恩；菲伦；剂量；阿波罗；DBAli工具；MATRAS公司；NUCPLOT公司；LIGPLOT公司；EMBOS公司；焦耳（Jmol） 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文