快速质量控制 swMATH ID: 16946 软件作者: 西蒙·安德鲁斯 说明: FastQC:用于高通量序列数据的质量控制工具。FastQC旨在提供一种简单的方法,对来自高通量测序管道的原始序列数据进行一些质量控制检查。它提供了一组模块化的分析,您可以使用它快速了解您的数据是否存在任何问题,在进行任何进一步的分析之前,您应该了解这些问题。FastQC的主要功能是:从BAM、SAM或FastQ文件(任何变体)导入数据;提供快速概述,告诉您哪些方面可能存在问题;快速评估数据的汇总图表;将结果导出到基于HTML的永久报告;离线操作,无需运行交互式应用程序即可自动生成报告 主页: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 相关软件: R(右);顶帽;Trimmomatic公司;生物导体;STAR公司;Cutadapt公司;KEGG公司;关贸总公司;边缘R;Samtools公司;BED工具;BLAT(爆炸);针织物;闪亮的;ggplot2;Rsamtools软件;ShortRead(短阅读);HT序列;Rqc(质量控制);俾斯麦 引用于: 8文件 全部的 前5名18位作者引用 1 阿卡林,阿尔图纳 1 吉列尔莫·巴图伦 1 彼得·布罗克韦尔(Peter J.Brockwell)。 1 理查德·戴维斯(Richard A.Davis)。 1 肖恩·戴维斯。 1 弗兰克,Verdan 1 迈克尔·哈肯伯格 1 马滕·贾格尔 1 数学,埃维 1 JoséL·奥利弗。 1 埃内斯托·皮卡尔迪 1 罗萨里奥·迈克尔·皮罗 1 斯文·拉赫曼 1 彼得·罗宾逊。 1 乔纳森·罗宁 1 奥尔·肖姆罗尼 1 博拉·乌亚尔 1 詹斯·曾格拉夫 4篇连载文章中引用 2 分子生物学方法 1 统计中的Springer文本 1 查普曼和霍尔/CRC数学和计算生物学系列 1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列 在4个字段中引用 7 生物学和其他自然科学(92-XX) 三 统计学(62-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 按年份列出的引文