奥廖内 swMATH ID: 16940 软件作者: Gianmauro Cuccuru、Massimiliano Orsini、Andrea Pinna、Andrea Sbardellati、Nicola Soranzo、Antonella Travaglione、Paolo Uva、Gianluigi Zanetti、Giorgio Fotia 描述: Orione是一个基于网络的微生物NGS分析框架。摘要:端到端的下一代测序微生物数据分析需要多种工具,包括细菌重测序、从头组装、支架、细菌RNA-Seq、基因注释和宏基因组学。然而,由于缺乏互操作性、再现性和透明度,使用不同软件包的计算管道的构建很困难。为了克服这些限制,我们提出了Orione,这是一个基于银河系的框架,由公开可用的研究软件和专门设计的管道组成,用于为下一代测序微生物学数据分析构建复杂、可重复的工作流程。Orione使微生物学研究人员能够在无需安装软件或编程的情况下进行自己的自定义分析和数据操作,为微生物学和宏基因组学中的数据密集型计算分析提供了新的机会。可用性和实施:Orione可在线访问http://orione.crs4.it。 主页: https://orione.crs4.it/ 相关软件: 剂量;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;浮雕;焦耳(Jmol);PhenomeNET公司;智能GO;啤酒节;FUNC公司;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;抗SMASH;解剖HMMER;HPMV(高压中压);安妮 引用于: 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文