FUNC公司 swMATH ID: 16930 软件作者: Kay Prüfer、Bjoern Muetzel、Hong Hai Do、Gunter Weiss、Philipp Khaitovich、Erhard Rahm、Svante Pääbo、Michael Lachmann、Wolfgang Enard 描述: FUNC:一个用于检测基因集和本体论注释之间显著关联的软件包。背景:全基因组表达、序列和关联研究通常会产生大量候选基因,必须对其进行进一步分析和解释。关于这些基因的信息越来越多地被捕获并组织在本体论中,例如基因本体论。通过实验方法确定的基因集和生物学知识之间的关系可以明确,并用于解释结果。然而,由于同时测试了许多相互依赖的类别,因此通常很难评估此类分析的统计显著性。结果:我们开发了程序包FUNC,其中包括并扩展了目前可用的方法,以识别基因集和本体论注释之间的显著关联。实现了几个特别适合全基因组序列比较的测试、家族错误率估计、错误发现率、结果全局重要性的敏感估计以及降低结果复杂性的算法。结论:FUNC是全基因组数据分析的通用工具。它在GPL许可下免费提供,也可以通过web服务访问。 主页: http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-8-41 相关软件: 剂量;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;浮雕;焦耳(Jmol);PhenomeNET公司;智能GO;啤酒节;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;抗SMASH;解剖HMMER;HPMV(高压中压);安妮 引用于: 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文