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水池-I

swMATH ID: 16914
软件作者: 水蛭、水蛭;清水,假名;Tamotsu Noguchi
描述: POODLE-I:基于工作流方法,通过整合POODLE序列和结构信息预测器进行无序区域预测。在生理条件下,许多蛋白质,特别是在真核生物中,被鉴定出含有缺乏明确三维结构的区域。这些区域通常发挥重要的生物细胞作用,尽管它们不能形成稳定的结构。因此,它们是生物学上显著的现象。从工业角度来看,它们可以为确定三维结构或设计药物提供有用的信息。由于这些原因,近年来,无序地区引起了人们的极大关注。因此,预计它们的准确预测将提供对广泛应用有用的注释。POODLE-I(其中“I”代表集成)是一个基于网络的无序区域预测系统。POODLE-I综合了三种无序区域预测因子(POODLEs)的预测结果,这三种预测因子是从无序区域的特征随长度变化的角度发展而来的。此外,POODLE-I通过应用工作流方法将该信息与预测的结构信息相结合。与CASP8表现最佳的服务器团队相比,POODLE-I排名靠前,在预测未折叠蛋白方面表现出最高的性能。POODLE-I是一种仅从氨基酸序列检测蛋白质中无序区域的有效工具。该应用程序可在以下网站免费获得:http://mbs.cbrc.jp/poodle/poodle-i.html。
主页: http://content.iospress.com/articles/in-silico-biology/isb00426
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