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埃斯普里茨

swMATH ID: 16911
软件作者: 伊恩·沃尔什、阿尔贝托·马丁、托马斯·迪·多梅尼科、西尔维奥·托萨托
描述: ESpritz:准确快速预测蛋白质紊乱。动机:内在无序区域是许多蛋白质功能的关键,可用的实验注释不足表明存在不同的无序风味。虽然需要有效的预测来注释整个基因组,但大多数现有方法都需要序列图谱来进行无序预测,这使得它们在高通量应用中变得很麻烦。结果:在这项工作中,我们提出了一套称为ESpritz的蛋白质紊乱预测因子。它们基于双向递归神经网络,并针对三种不同类型的无序进行训练,包括一种新的NMR灵活性预测器。ESpritz可以快速准确地进行序列预测,在单个处理器内核上按小时顺序注释整个基因组。或者,对于需要最大性能的应用程序,可以使用使用序列配置文件的较慢但稍准确的ESpritz变体。两级预测置信度可以最大限度地提高合理的紊乱检测或将预期误报限制在5
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/28/4/503.short
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