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PROFbval公司

swMATH编号: 16905
软件作者: Avner Schlessinger、Guy Yachdav、Burkhard Rost
描述: PROFbval:预测蛋白质中的柔性和刚性残基。摘要:蛋白质表面残基的流动性与其功能密切相关。因此,识别极为刚性或柔性的表面残基可以为解决识别蛋白质中功能重要残基的复杂问题提供至关重要的信息。通常通过来自高分辨率三维X射线结构的B值数据来测量迁移率。很少有方法从序列中预测B值。在这里,我们介绍了PROFbval,这是第一个从氨基酸序列预测归一化B值的网络服务器。服务器将氨基酸序列(或比对)作为输入进行处理,并输出标准化的B值和二态(柔性/刚性)预测。服务器还为每个预测分配一个可靠性指数。例如,PROFbval正确地将酶表面活性位点中的残基识别为特别刚性。可利用性:http://www.rostlab.org/services/profbval
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/22/7/891.short网站
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