SFCHECK（SF检查） swMATH ID: 16888 软件作者： A.A.Vaguine、J.Richelle、S.J.Wodak 描述： SFCHECK：一套统一的程序，用于评估大分子结构因子数据的质量及其与原子模型的一致性。在本文中，我们介绍了SFCHECK，这是一个独立的软件包，具有一套统一的程序，用于评估从X射线衍射实验中获得的结构因子数据，以及评估原子坐标与这些数据的一致性。评估完全自动执行，并生成与PROCHECK类似的简明PostScript图形输出[Laskowski、MacArthur、Moss和Thornton（1993）.J.Appl.Cryst.26、283-291]，极大地促进了结果的视觉检查。所需的输入是结构因子振幅和原子坐标。在此基础上，程序总结了沉积结构因子的相关信息，并使用数据完整性、结构因子不确定性和从Patterson原点峰值计算的光学分辨率等标准评估其质量。还给出了各种参数对标称分辨率（d间距）的依赖性。为了评估原子模型与实验数据的整体一致性，程序重新计算了R因子、观测和计算的结构因子振幅与Rfree（适当时）之间的相关系数。此外，它给出了原子坐标中平均误差的几种估计。分别考虑大分子主链和侧链原子以及溶剂原子和杂原子，对模型和电子密度图之间的局部一致性进行了全面评估。其中包括归一化平均原子位移、局部密度相关系数和聚合物链连接性。还提供了使用省略映射程序计算这些标准的可能性。所描述的软件应该是一个有价值的工具，用于监控优化过程和评估数据库中存储的结构。 主页： http://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper？S090744998006684 相关软件： 剂量；阿波罗；DBAli工具；MATRAS公司；NUCPLOT公司；LIGPLOT公司；浮雕；焦耳（Jmol）；PhenomeNET公司；智能GO；啤酒节；FUNC公司；Aber-OWL公司；工厂TFDB；鸡蛋NOG；ELM公司；数据库CAN；抗SMASH；解剖HMMER；HPMV（高压中压）；安妮 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文