CUPSAT公司 swMATH ID: 16877 软件作者: Vijaya Parthiban、M.Michael Gromiha、Dietmar Schomburg 描述: CUPSAT:预测点突变后的蛋白质稳定性。CUPSAT(科隆大学蛋白质稳定性分析工具)是一个网络工具,用于分析和预测点突变(单氨基酸突变)时蛋白质稳定性的变化。该程序使用结构环境特定的原子势和扭角势来预测ΔΔG,即野生型和突变型蛋白质去折叠自由能的差异。它需要蛋白质数据库格式的蛋白质结构和突变残基的位置。输出包括关于突变位点、其结构特征(溶剂可及性、二级结构和扭转角)的信息,以及关于特定氨基酸突变的19个可能取代的蛋白质稳定性变化的综合信息。此外,它还分析了突变氨基酸适应观察到的扭转角的能力。对1538个热变性突变和1603个化学变性突变进行了测试。为了确保预测方法的可靠性、准确性和可转移性,进行了几项验证测试(分样、刀切和k折),得出>80 主页: http://nar.oxfordjournals.org/content/34/suppl_2/W239.short 相关软件: PoPMuSiC公司;自动静音;剂量;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;浮雕;焦耳(Jmol);PhenomeNET公司;智能GO;啤酒节;FUNC公司;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;抗SMASH 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 埃米尔·阿列克索夫 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 1 玛丽亚·米提娃。 1 王,林 1 张哲 2篇连载文章中引用 1 医学中的计算和数学方法 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文