ShortRead(短阅读) swMATH编号: 16605 软件作者: 马丁·摩根、西蒙·安德斯、迈克尔·劳伦斯、帕特里克·阿布尤恩、埃尔维·帕格斯、罗伯特·绅士 描述: ShortRead:用于输入、质量评估和探索高通量序列数据的生物导体包。ShortRead是一个用于输入、质量评估、操作和输出高通量测序数据的包。ShortRead是在R和Bioconductor环境中提供的,允许随时访问其他设施,以进行高级统计分析、数据转换、可视化以及与各种基因组资源的集成。 主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/25/19/2607.short 依赖项: R(右) 相关软件: 生物导体;R(右);ggplot2;Rsamtools软件;顶帽;Trimmomatic公司;快速质量控制;Rqc(质量控制);边缘R;针织物;闪亮的;生物并行;DEseq公司;HT序列;教授;网格化R;叉;专业工具;卢比;PBLAS公司 引用于: 2文件 5位作者引用 1 阿卡林,阿尔图纳 1 佛兰德·弗兰克 1 塞德里克·贡德罗 1 乔纳森·罗宁 1 博拉·乌亚尔 2篇连载文章中引用 1 使用R! 1 查普曼和霍尔/CRC计算生物学系列 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文