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ShortRead(短阅读)

swMATH编号: 16605
软件作者: 马丁·摩根、西蒙·安德斯、迈克尔·劳伦斯、帕特里克·阿布尤恩、埃尔维·帕格斯、罗伯特·绅士
描述: ShortRead:用于输入、质量评估和探索高通量序列数据的生物导体包。ShortRead是一个用于输入、质量评估、操作和输出高通量测序数据的包。ShortRead是在R和Bioconductor环境中提供的,允许随时访问其他设施,以进行高级统计分析、数据转换、可视化以及与各种基因组资源的集成。
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/25/19/2607.short
依赖项: R(右)
相关软件: 生物导体;R(右);ggplot2;Rsamtools软件;顶帽;Trimmomatic公司;快速质量控制;Rqc(质量控制);边缘R;针织物;闪亮的;生物并行;DEseq公司;HT序列;教授;网格化R;;专业工具;卢比;PBLAS公司
引用于: 2文件

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