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前乳酸酶

swMATH ID: 16470
软件作者: 拉文德拉·库马尔;阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦;班达纳库马里;马尼什·库马尔
描述: 用Chou伪氨基酸组成和支持向量机预测β-内酰胺酶及其分类。β-内酰胺类抗生素被用作对抗许多致病微生物的主要治疗剂。抗生素在治疗细菌感染中的广泛和不加区分的使用,促使了几种逃避抗生素致命作用的机制的演变。β-内酰胺酶是一种内源性产生的酶,它通过裂解β内酰胺环使细菌对β-内内酰胺类抗生素产生耐药性。根据一级结构,β内酰胺酶家族可分为四类,即A、B、C和D。B类是金属酶,A、,C和D在酶催化中不需要任何金属。在本研究中,我们开发了一种基于支持向量机的两级β-内酰胺酶蛋白质预测方法,该方法在第一级区分β-内糖酶和非β-内酰酶,然后在第二级将预测的β-内酯酶分为不同类别。我们评估了不同输入载体的性能,即简单氨基酸组成、1型和2型Chou的伪氨基酸组成。性能比较表明,基于1型伪氨基酸组成训练的SVM模型具有最佳性能。在第一个水平上,我们能够将β-内酰胺酶与非β-内内酰胺酶进行分类,结果为90.63
主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519314005979
关键词: \(eta)-内酰胺酶蛋白抗生素耐药性不参与交叉验证
相关软件: iRSpot-PseDNC公司iPro54-PseKNC综合布线邻硝基-Tyr财产iCTX类型iPPI-Esml接口iAMP-2L型iEnhancer-2L型pSuc-Lys基因iTIS-SeTNC公司PseKNC公司iDNA-甲基iNuc-PseKNCiSNO-AAP航空公司iLoc-Hum公司国际RSpot-TNCPseAACPseAAC-建筑商iHyd-PseAAC公司iLoc动物
引用于: 12文件

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