snoSeeker（搜索引擎） swMATH ID: 15009 软件作者： 杨，J.H.，张，X.C.，黄，Z.P.，周，H.，黄，M.B.，张，S.，陈，Y.Q.，曲，L.H。 描述： snoSeeker：一个高级计算软件包，用于筛选人类基因组中的引导和孤立sno RNA基因。小核仁RNA（snoRNAs）是真核生物中大量存在的非编码RNA。根据rRNAs或snRNAs反义序列的存在与否，它们可以分为引导型和孤立型snoRNAs。目前的snoRNAs搜索程序基本上是基于对rRNAs或snRNAs的序列互补性，仅用于筛选指导性snoRNAs。在本研究中，我们开发了一个高级计算软件包snoSeeker，其中包括CDseeker和ACAseeker程序，用于高效、特异地筛选哺乳动物基因组中的引导和孤立snoRNA基因。通过使用这些程序，我们系统地扫描了四个人类-哺乳动物全基因组比对（WGA）序列，并鉴定了54个新候选基因，包括26个孤儿候选基因和266个已知snoRNA基因。18个新的snoRNA被进一步实验证实，其中4个snoRNA表现出组织特异性或限制性表达模式。这项研究的结果提供了迄今为止人类基因组中两个snoRNA基因家族的最全面列表。 主页： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16990247 相关软件： 科福尔加;ddb核糖核酸;MARNA公司;PSoL公司;ProMiR II项目;S折叠;RNA动力学;RSEACH公司;Pfold（折叠）;CONTRAfold公司;阿拉贡;T-咖啡;百万倍;tRNA扫描-SE;RNA形状;法国皇家医学会 引用于： 1文件 3位作者引用 1 埃尔南多·德尔·波蒂略。 1 阿兰·米切尔·达勒姆 1 阿丽亚娜·马查多·利马 连载1篇 1 数学生物学杂志 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文