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Samtools公司

swMATH ID: 14583
软件作者: 李H.、Handsaker B.、Wysoker A.、Fennell T.、Ruan J.、Homer N.、Marth G.、Abecasis G.、Durbin R
描述: Samtools是一套用于与高通量测序数据交互的程序。它由三个独立的存储库组成:Samtools:读/写/编辑/索引/查看SAM/BAM/CRAM格式。BCF工具:读取/写入BCF2/VCF/gVCF文件,调用/过滤总结SNP和短indel序列变体。HTSlib:一个用于读/写高通量测序数据的C库。Samtools和BCFtools都在内部使用HTSlib,但这些源包包含自己的HTSlib副本,因此可以独立构建。
主页: 网址:http://www.htslib.org/
相关软件: BWA公司;香皂;关贸总公司;R(右);MAFFT公司;VarScan(可变扫描);BLAT(爆炸);Trimmomatic公司;快速质量控制;STAR公司;BED工具;BCF工具;PAML公司;蝴蝶结2;图案猎人;天鹅绒;FASTX公司;UniProt公司;SnpEff公司;HT序列
引用于: 17文件

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