Samtools公司 swMATH ID: 14583 软件作者: 李H.、Handsaker B.、Wysoker A.、Fennell T.、Ruan J.、Homer N.、Marth G.、Abecasis G.、Durbin R 描述: Samtools是一套用于与高通量测序数据交互的程序。它由三个独立的存储库组成:Samtools:读/写/编辑/索引/查看SAM/BAM/CRAM格式。BCF工具:读取/写入BCF2/VCF/gVCF文件,调用/过滤总结SNP和短indel序列变体。HTSlib:一个用于读/写高通量测序数据的C库。Samtools和BCFtools都在内部使用HTSlib,但这些源包包含自己的HTSlib副本,因此可以独立构建。 主页: 网址:http://www.htslib.org/ 相关软件: BWA公司;香皂;关贸总公司;R(右);MAFFT公司;VarScan(可变扫描);BLAT(爆炸);Trimmomatic公司;快速质量控制;STAR公司;BED工具;BCF工具;PAML公司;蝴蝶结2;图案猎人;天鹅绒;FASTX公司;UniProt公司;SnpEff公司;HT序列 引用于: 17文件 全部的 前5名51位作者引用 1 吉列尔莫·巴图伦 1 盖坦·贝诺特 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 安妮城堡 1 列奥尼德·钦德列维奇 1 克莱门·达拉德 1 尼克·德克斯特。 1 德雷岑,埃尔旺 1 弗兰克·艾森哈伯 1 吉安卡洛·拉斐尔 1 鲁道夫·吉卢杜 1 卡马拉卡古鲁科塔 1 迈克尔·哈肯伯格 1 黄益民 1 马滕·贾格尔 1 季、袁 1 乔纳森·基思(Jonathan M.Keith)。 1 多米尼克·拉维尼耶 1 迈克尔·劳伦斯。 1 Lee,Juhee先生 1 克莱尔·勒迈特尔 1 麦克斯韦·利布雷希特 1 刘江斌 1 刘永超 1 吕志宝 1 马丁·摩根 1 彼得·米勒 1 JoséL·奥利弗。 1 罗萨里奥·迈克尔·皮罗 1 阿尔贝托,Policriti 1 纪尧姆·里兹克 1 彼得·罗宾逊。 1 Amir Hosein野生动物园 1 戴维·斯卡特罗 1 贝蒂尔·施密特 1 纳菲西·塞达加特 1 奥尔·肖姆罗尼 1 恩里科·西拉古萨 1 孙骏 1 亚历山德鲁·伊昂·托梅斯库 1 菲利波·乌特罗 1 弗朗西斯科·维齐 1 王伟 1 大卫·威斯 1 魏智 1 马蒂亚斯·韦勒 1 亚历山大·沃尔夫 1 吴伟 1 徐伟爵 1 胡曼·扎贝蒂 1 赵志根 全部的 前5名7篇连载文章中引用 2 应用统计学年鉴 2 分子生物学方法 1 计算机与系统科学杂志 1 统计科学 1 数学生物科学与工程 1 计算机科学评论 1 查普曼和霍尔/CRC数学和计算生物学系列 全部的 前5名在6个字段中引用 15 生物学和其他自然科学(92-XX) 6 计算机科学(68至XX) 4 统计学(62-XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文