贞洁

Chaste:将一个新的多尺度时空算法整合到一个大型开源库中。最近的工作描述了作为癌症、心脏和软组织环境(Chaste)项目的一部分而建立的软件工程和计算基础设施。Chaste是一个开源软件包,目前具有心脏和癌症建模功能。这个软件是用从商业领域引进的编程范例编写的,它的代码经过了比这个领域通常要严格得多的测试程序。在本文中,我们将解释如何将新功能整合到chate中。Whiteley开发了一种求解bidomain方程的数值算法,该算法利用生理学模型的多尺度特性来提高计算效率。使用一个二维的简单几何体和一个专门构建的代码,该算法被报道可以使计算效率提高两个数量级以上。在这篇文章中,我们首先回顾了目前用于求解bidomain方程的数值方法,解释了这些方法是如何发展为使用上面讨论的MS算法的。然后,我们演示了该算法在Chaste框架内用于求解三维真实心脏几何中的单域和双域方程。最后,我们将讨论如何开发贞洁来包含新的生理功能,例如模拟心脏跳动和心脏中的液体流动,以及如何结合旨在提高代码效率的新算法。


zbMATH中的参考文献(参考文献49条,2标准条款)

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按年份排序(引用)
  1. Sophie Theis,Magali Suzanne,Guillaume Gay:Tyssue:上皮模拟库(2021)不是zbMATH
  2. Cooper等人:《贞洁:癌症、心脏和软组织环境》(2020)不是zbMATH
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