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普索特布

swMATH编号: 11344
软件作者: Gardy,J.L。;Laird,M.R。;陈,F。;Rey,S。;沃尔什·C·J。;埃斯特,M。;布林克曼,F.S.L。
描述: Psortb v.2.0:细菌蛋白质亚细胞定位的扩展预测和从比较蛋白质组分析中获得的见解。动机:PSORTb v.1.1是目前最精确的细菌定位预测工具。然而,该程序的预测覆盖率和召回率较低,且该方法仅适用于革兰氏阴性菌。本工作的目标如下:在保持现有精度水平的同时,增加PSORTb的覆盖率,将其扩展到包括革兰氏阳性菌,然后进行定位对比分析。结果:PSORTb v.2.0中引入了一个扩展的已知定位蛋白质数据库和使用频繁子序列支持向量机的新模块。该程序的精度为96
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/21/5/617.short
相关软件: 位置传感器;欧盟-mPLoc;Gneg-mPLoc公司;ESLpred公司;爆炸;PSI-爆炸;Gpos-PLoc公司;TMB-狩猎;LOCSVMPSI公司;Pfam公司;哼-mPLoc;iLoc-Virus病毒;菲比乌斯;ExPASy公司;机密P;沃尔夫PSORT;Memtype-2L型;病毒定位;欧洲公共图书馆;PSLpred公司
引用于: 13文件

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